More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1153 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  960    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  63.89 
 
 
469 aa  626  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  60.44 
 
 
464 aa  555  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  56.68 
 
 
466 aa  546  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  54.64 
 
 
472 aa  520  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  49.35 
 
 
634 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  49.24 
 
 
633 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.83 
 
 
580 aa  350  4e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  38.89 
 
 
512 aa  346  5e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  35.79 
 
 
509 aa  336  5e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  36.97 
 
 
502 aa  333  4e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  37.27 
 
 
491 aa  332  1e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  36.73 
 
 
503 aa  323  6e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  37.73 
 
 
614 aa  264  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  33.84 
 
 
667 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  37.74 
 
 
588 aa  246  4e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  34.06 
 
 
592 aa  242  9e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  34.71 
 
 
594 aa  236  6e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  35.13 
 
 
594 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  32.89 
 
 
879 aa  228  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  32.46 
 
 
878 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.82 
 
 
885 aa  219  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  33.11 
 
 
880 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  29.54 
 
 
796 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  32.39 
 
 
896 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  27.55 
 
 
441 aa  173  5e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  26.23 
 
 
428 aa  170  6e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  26 
 
 
428 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  26 
 
 
428 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  27.39 
 
 
428 aa  168  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.52 
 
 
421 aa  161  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.39 
 
 
723 aa  117  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.89 
 
 
784 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0799  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.74 
 
 
755 aa  97.1  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.6 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1702  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.59 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1630  sulfate adenylyltransferase subunit 2  27.62 
 
 
268 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000248691  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0828  sulfate adenylyltransferase subunit 2  30.88 
 
 
312 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.37 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0801  sulfate adenylyltransferase subunit 2  30.19 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.14 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.32 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.9 
 
 
220 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238936  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2289  sulfate adenylyltransferase subunit 2  30.17 
 
 
301 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.58 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1567  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.59 
 
 
224 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.779448  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2353  sulfate adenylyltransferase subunit 2  27.88 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.295383  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0959  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.92 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.70821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2182  sulfate adenylyltransferase subunit 2  28.37 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4661  sulfate adenylyltransferase, small subunit  27.4 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423363  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  27 
 
 
487 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1501  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  28.93 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.178392  normal  0.54749 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2786  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  25.26 
 
 
244 aa  67  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1531  sulfate adenylyltransferase subunit 2  29.05 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0717  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.82 
 
 
303 aa  67  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.528578  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2344  sulfate adenylyltransferase subunit 2  27.4 
 
 
302 aa  67  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.98 
 
 
246 aa  67  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0739  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.27 
 
 
229 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00726569  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3943  sulfate adenylyltransferase subunit 2  31.37 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1800  sulfate adenylyltransferase subunit 2  29.33 
 
 
312 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121561  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.39 
 
 
257 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3594  sulfate adenylyltransferase, small subunit  28.85 
 
 
309 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644798  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3187  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.92 
 
 
302 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2424  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  25.98 
 
 
234 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.238149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1476  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25.86 
 
 
234 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1294  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.12 
 
 
235 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0665  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.23 
 
 
249 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390577  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1168  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.23 
 
 
249 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.206171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1015  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.23 
 
 
249 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5480  sulfate adenylyltransferase subunit 2  29.33 
 
 
311 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0232968  decreased coverage  0.0059781 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1660  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.23 
 
 
249 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1008  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.23 
 
 
249 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  22.95 
 
 
234 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2624  sulfate adenylyltransferase subunit 2  27.4 
 
 
304 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2429  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  26.24 
 
 
264 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.149662  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2346  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.23 
 
 
249 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2939  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.23 
 
 
249 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0821  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.88 
 
 
247 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3868  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25.86 
 
 
234 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1261  sulfate adenylyltransferase subunit 2  28.43 
 
 
315 aa  64.7  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115941  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2145  sulfate adenylyltransferase subunit 2  27.88 
 
 
303 aa  64.3  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.4 
 
 
237 aa  64.7  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3830  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.01 
 
 
265 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  27.17 
 
 
234 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2734  sulfate adenylyltransferase subunit 2  27.88 
 
 
304 aa  64.3  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0448495  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2191  sulfate adenylyltransferase subunit 2  29.33 
 
 
309 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0716  sulfate adenylyltransferase, small subunit  26.25 
 
 
315 aa  63.9  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284708  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0962  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.44 
 
 
302 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3408  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.44 
 
 
302 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1497  sulfate adenylyltransferase, small subunit  26.44 
 
 
300 aa  63.5  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1067  sulfate adenylyltransferase subunit 2  30.62 
 
 
297 aa  63.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1789  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  29.89 
 
 
267 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000854791  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0816  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27 
 
 
249 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50151  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1152  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.9 
 
 
251 aa  63.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0954  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.44 
 
 
302 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658343  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6393  sulfate adenylyltransferase subunit 2  27.97 
 
 
319 aa  63.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.921257  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1787  sulfate adenylyltransferase subunit 2  28.37 
 
 
319 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0750  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.47 
 
 
237 aa  63.5  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0928  sulfate adenylyltransferase subunit 2  26.44 
 
 
302 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2451  sulfate adenylyltransferase subunit 2  27.88 
 
 
322 aa  63.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>