More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0954 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  96.03 
 
 
428 aa  802    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  80.14 
 
 
428 aa  723    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  853    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  93.93 
 
 
428 aa  786    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  64.01 
 
 
441 aa  551  1e-156  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  35.36 
 
 
667 aa  259  6e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  32.85 
 
 
796 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.93 
 
 
421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  31.28 
 
 
896 aa  213  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.47 
 
 
885 aa  210  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  37.94 
 
 
879 aa  204  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  31.04 
 
 
880 aa  194  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  29.82 
 
 
878 aa  189  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  34.19 
 
 
633 aa  186  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  35 
 
 
509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  28.27 
 
 
469 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  29.84 
 
 
491 aa  176  9e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  27.85 
 
 
634 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  26.93 
 
 
469 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  29.27 
 
 
594 aa  171  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  29.62 
 
 
512 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  29.11 
 
 
592 aa  169  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  29.57 
 
 
594 aa  168  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  28.81 
 
 
503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  26 
 
 
466 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  29.9 
 
 
614 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.02 
 
 
580 aa  164  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  28.4 
 
 
502 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  24.94 
 
 
464 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  33.99 
 
 
472 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  28.33 
 
 
588 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.05 
 
 
723 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.64 
 
 
784 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0799  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.13 
 
 
755 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2969  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.13 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  decreased coverage  0.00395562 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1789  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  25.99 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000854791  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.21 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3393  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.51 
 
 
273 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.41 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0413  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.56 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  29.38 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.6 
 
 
238 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1294  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.96 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2246  adenylylsulfate reductase  28.7 
 
 
241 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.445437  normal  0.0256026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.89 
 
 
273 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0260  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.89 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0812  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.38 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3703  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.52 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1889  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.26 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1669  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.87 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400633  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3475  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.91 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.91 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3538  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.91 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2786  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  23.5 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5533  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.22 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1147  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.03 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2468  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.13 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.614171  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4543  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.14 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.591012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2337  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  27.1 
 
 
261 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1777  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27.91 
 
 
238 aa  72.8  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138147  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3436  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.85 
 
 
254 aa  72.8  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  hitchhiker  0.0011712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4083  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.15 
 
 
251 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5329  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.4 
 
 
278 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.176217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.93 
 
 
276 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2429  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25.36 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.149662  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3309  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.26 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1263  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  27.78 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405389  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.26 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480804  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.39 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0796  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.76 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5428  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.31 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2192  phosophoadenylyl-sulfate reductase  28.64 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2506  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.64 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3141  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.26 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.74 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3258  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.26 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3076  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.26 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3157  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.88 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.267465 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1567  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.52 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.779448  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.74 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0017648  normal  0.150799 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5808  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.74 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000032081 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0706  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  30.3 
 
 
239 aa  68.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.96 
 
 
234 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2890  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.7 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.87 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.293711 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02607  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.7 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0926  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.7 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.518681  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02570  hypothetical protein  25.7 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3064  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.7 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.696985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3113  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.7 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2902  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.7 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25.6 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3100  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.7 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.337134  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0527  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.08 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277121  normal  0.296844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1759  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.06 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.79 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0950  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.7 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.218677 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1344  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  25.6 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0837  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.91 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4016  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.7 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.634763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>