More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2520 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2520  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.783143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  69.4 
 
 		 235 aa  330  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  65.22 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  64.35 
 
 		 237 aa  289  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  47.92 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  46.88 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  34.59 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  37.09 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  44.79 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530089  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.8 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  32.64 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  31.94 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  31.94 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 711 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  32.64 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  32.64 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  32.64 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  31.94 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.99 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  31.94 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  33.99 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  43 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  39.69 
 
 		 710 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.82 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  35.4 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.58 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0781  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  35.88 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.14 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.3 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  35.4 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  35.4 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  40.59 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  40 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.62 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 241 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  34.1 
 
 		 248 aa  62  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1178  methyltransferase type 11  39.66 
 
 		 186 aa  62  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.140989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  36.84 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  32.46 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6684  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.62 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00241192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  29.59 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.03 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.25 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.08 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0789  methyltransferase type 11  55.77 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.54 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  32.14 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  32.14 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  38.84 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 634 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0807  methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  32.34 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  32.85 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  33.33 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  32.74 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  39.6 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.41 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.28 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.54 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0278  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.85 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.831577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.93 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 362 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  40 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  30.77 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3368  2-polyprenylmethoxybenozoquinol methylase  37.72 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.79 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 		 1106 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  31.36 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4511  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  37.39 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0983  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.46 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2735  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  36.63 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  30.23 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.23 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>