249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1320 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  100 
 
 
315 aa  647    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  44.63 
 
 
403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  45.1 
 
 
402 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  46.71 
 
 
399 aa  273  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  46.91 
 
 
412 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  38.36 
 
 
350 aa  209  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  41.15 
 
 
214 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  49.11 
 
 
211 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  40.67 
 
 
229 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  42.39 
 
 
213 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  36.79 
 
 
241 aa  143  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  45.83 
 
 
217 aa  142  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  46.34 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  45.83 
 
 
217 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  38.32 
 
 
217 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  41.76 
 
 
215 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  41.62 
 
 
216 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  46.82 
 
 
219 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  42.86 
 
 
279 aa  136  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  41.42 
 
 
216 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  42.01 
 
 
213 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  43.2 
 
 
217 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  39.39 
 
 
209 aa  132  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  39.91 
 
 
218 aa  132  9e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  36.62 
 
 
207 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
221 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  39.31 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  36.15 
 
 
217 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14201  hypothetical protein  39.29 
 
 
217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10751  hypothetical protein  35.41 
 
 
215 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13391  hypothetical protein  35.54 
 
 
214 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.417782  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
237 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13691  hypothetical protein  33.94 
 
 
212 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0487979  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13601  hypothetical protein  32.73 
 
 
212 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1268  hypothetical protein  33.74 
 
 
212 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.391733  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0372  SAM-dependent methyltransferase  36.42 
 
 
216 aa  99.4  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118814  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10541  hypothetical protein  34.55 
 
 
216 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.864146  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51541  methionine-dependent methyltransferase  27.04 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
240 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  28.86 
 
 
243 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  28.86 
 
 
243 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  28.86 
 
 
243 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  45.07 
 
 
252 aa  58.9  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
225 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
238 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
225 aa  56.6  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  40.3 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
269 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  30.1 
 
 
269 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
272 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  27.34 
 
 
237 aa  53.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  30.56 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 
237 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  35.71 
 
 
247 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  28.36 
 
 
243 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  44.9 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  25.78 
 
 
238 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  38.36 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  38.98 
 
 
241 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  27.91 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  27.01 
 
 
249 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
239 aa  50.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.48 
 
 
235 aa  50.1  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  36.47 
 
 
275 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  39.62 
 
 
237 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  37.74 
 
 
237 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30 
 
 
258 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  36.76 
 
 
246 aa  49.7  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000587821  hitchhiker  0.0091617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2735  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  35.29 
 
 
243 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0158342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.01 
 
 
243 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887672  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
241 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
241 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  29.85 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
411 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.38 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 
219 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 
196 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  51.28 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  30.3 
 
 
870 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
1106 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.19 
 
 
243 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0649  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.24 
 
 
243 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.01 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28603  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  44.23 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0241  methyltransferase type 11  33.72 
 
 
255 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.114576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  44 
 
 
710 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.86 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  31.52 
 
 
276 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0215  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  37.14 
 
 
244 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.18 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  27.15 
 
 
245 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  35.53 
 
 
272 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  38.33 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>