51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0866 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  62.62 
 
 
213 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  25.48 
 
 
239 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  46.88 
 
 
189 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  34.07 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  40.79 
 
 
181 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 
507 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  34.57 
 
 
238 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  31.33 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
324 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 
511 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  36.78 
 
 
214 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  37.1 
 
 
280 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
228 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3844  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
192 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  36.07 
 
 
310 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  31.03 
 
 
870 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  37.88 
 
 
322 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  30.89 
 
 
324 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  32.5 
 
 
1124 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  45.4  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  40 
 
 
231 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3542  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.59 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08910  polyketide synthase, putative (JCVI)  26.28 
 
 
2449 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  28.24 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  30.12 
 
 
457 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0045  Methyltransferase type 12  39.62 
 
 
264 aa  43.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3662  Methyltransferase type 12  35.06 
 
 
391 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.563292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4739  Methyltransferase type 12  35.06 
 
 
391 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751981  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0747  hypothetical protein  29.07 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.034536  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
248 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
706 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2892  methyltransferase type 12  26.88 
 
 
311 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0410  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
233 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  24.68 
 
 
242 aa  42.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1601  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  36.36 
 
 
284 aa  42.4  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  47.62 
 
 
253 aa  42  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
866 aa  42  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 
222 aa  42  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  31.73 
 
 
194 aa  42  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
1094 aa  42  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  27.18 
 
 
237 aa  41.6  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  36 
 
 
360 aa  41.6  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>