296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3920 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 358 aa  719    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  80 
 
 		 361 aa  584  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  82.54 
 
 		 358 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  51.58 
 
 		 365 aa  342  5e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  47.27 
 
 		 377 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  46.95 
 
 		 375 aa  315  7e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  37.19 
 
 		 421 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  39.43 
 
 		 431 aa  226  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  38.59 
 
 		 415 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  36.8 
 
 		 418 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  36.8 
 
 		 418 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  35.81 
 
 		 434 aa  219  7.999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.79 
 
 		 431 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  38.14 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.25 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  36.55 
 
 		 446 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.04 
 
 		 357 aa  170  4e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  29.35 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  34.65 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.85 
 
 		 387 aa  143  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  33.24 
 
 		 381 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  31.38 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  28.91 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 		 488 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  26.65 
 
 		 489 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  29.13 
 
 		 438 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  28.86 
 
 		 373 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  31.85 
 
 		 671 aa  126  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  31.75 
 
 		 424 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  29.56 
 
 		 657 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  29.05 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  32.72 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  29.62 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  32.37 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  33.24 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 		 373 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.94 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  27.89 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  29.74 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  27.65 
 
 		 468 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  26.43 
 
 		 464 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  26.74 
 
 		 335 aa  116  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  28.93 
 
 		 356 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  29.5 
 
 		 362 aa  116  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  29.53 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  28.45 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  27.23 
 
 		 689 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  26.82 
 
 		 452 aa  113  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  25.83 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  29.1 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  28.18 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  26.21 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.77 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  25.89 
 
 		 698 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  29.15 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  26.2 
 
 		 686 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  29.97 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  28.86 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  28.18 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  28.69 
 
 		 349 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  30.93 
 
 		 399 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.77 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  28.83 
 
 		 652 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  24.67 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  30.92 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.7 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  26.05 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  24.77 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  27.48 
 
 		 352 aa  104  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  27.09 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  29.86 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  24.62 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  31.2 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  31.91 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  26.88 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  27.42 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  29.89 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  37.99 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  28.89 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  28.65 
 
 		 364 aa  99.8  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.68 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  29.5 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  33.33 
 
 		 406 aa  97.1  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 		 371 aa  96.3  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  25.45 
 
 		 361 aa  96.3  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  22.41 
 
 		 355 aa  96.3  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  27.9 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.86 
 
 		 312 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>