More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26030 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  100 
 
 
431 aa  875    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  51.28 
 
 
421 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  49.54 
 
 
434 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  49.76 
 
 
431 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  50.49 
 
 
418 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  50.49 
 
 
418 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  51.29 
 
 
443 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  48.71 
 
 
415 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  51.52 
 
 
446 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  41.6 
 
 
377 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  42.22 
 
 
375 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.62 
 
 
415 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  39.3 
 
 
361 aa  223  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  39.43 
 
 
358 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  37.23 
 
 
365 aa  219  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  37.89 
 
 
358 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.14 
 
 
357 aa  167  4e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  31.88 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  32.4 
 
 
389 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  31.89 
 
 
424 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  29.47 
 
 
395 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.43 
 
 
387 aa  159  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  29.13 
 
 
381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  29.15 
 
 
385 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  32.06 
 
 
652 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 
340 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  30.96 
 
 
440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  29.85 
 
 
657 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  30.96 
 
 
440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  32.38 
 
 
374 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  32 
 
 
361 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  29.44 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30.87 
 
 
671 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 
320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.9 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  30.69 
 
 
310 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 
689 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
313 aa  133  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  28.5 
 
 
468 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  28.15 
 
 
390 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  31.33 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  28.87 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  28.76 
 
 
488 aa  129  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  37.26 
 
 
283 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  30.08 
 
 
308 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.87 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  28.28 
 
 
438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  29.04 
 
 
370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  27.07 
 
 
361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  25.43 
 
 
388 aa  128  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.24 
 
 
362 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  25.7 
 
 
489 aa  126  6e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  28.43 
 
 
686 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  30.87 
 
 
352 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  27.97 
 
 
398 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  25.5 
 
 
474 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  27 
 
 
698 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  26.57 
 
 
360 aa  124  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  28.34 
 
 
508 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  27.92 
 
 
500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  27.95 
 
 
468 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  26.84 
 
 
406 aa  119  9e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  25.46 
 
 
335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 
402 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  28.3 
 
 
362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  30.21 
 
 
373 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  29.31 
 
 
518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  24.49 
 
 
438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  28.98 
 
 
313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  26.75 
 
 
406 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 
412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.42 
 
 
362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  26.47 
 
 
450 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  29.15 
 
 
440 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.08 
 
 
501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  35.8 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  28.68 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  25.96 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 
358 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.63 
 
 
423 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  31.2 
 
 
435 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  31.5 
 
 
434 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  27.74 
 
 
393 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  25.81 
 
 
492 aa  106  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  26.18 
 
 
323 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 
375 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  27.78 
 
 
313 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  27.21 
 
 
409 aa  106  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  40.78 
 
 
632 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  25.92 
 
 
317 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
371 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 
318 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 
395 aa  104  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
415 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  28.89 
 
 
355 aa  103  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  25.38 
 
 
437 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>