297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_36050 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 
501 aa  1031    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  60.9 
 
 
492 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  47.24 
 
 
500 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  38.02 
 
 
508 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  29.35 
 
 
686 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  28.7 
 
 
698 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  28.1 
 
 
689 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  29.27 
 
 
671 aa  147  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  27.25 
 
 
395 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.11 
 
 
434 aa  137  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  27.08 
 
 
421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  30.46 
 
 
438 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  26.43 
 
 
418 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.43 
 
 
418 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.07 
 
 
488 aa  123  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  26.75 
 
 
406 aa  123  8e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.23 
 
 
431 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  24.89 
 
 
468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  27.21 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 
440 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 
440 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  26.28 
 
 
424 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  27.08 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  26.72 
 
 
389 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  27.23 
 
 
377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  26.98 
 
 
443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  24.15 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.35 
 
 
313 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  26.05 
 
 
502 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  26.97 
 
 
355 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  32.35 
 
 
308 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  25.49 
 
 
450 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2061  DNA-cytosine methyltransferase  26.12 
 
 
511 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  35.51 
 
 
374 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  32.54 
 
 
468 aa  97.1  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4264  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 
508 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  29.86 
 
 
361 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  48.57 
 
 
652 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  33.17 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  32.18 
 
 
334 aa  93.2  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  31.67 
 
 
370 aa  93.2  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  29.9 
 
 
313 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  29.11 
 
 
283 aa  92.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  32 
 
 
318 aa  91.3  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  34.52 
 
 
415 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  32.8 
 
 
365 aa  90.9  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  32.84 
 
 
329 aa  90.1  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  23.59 
 
 
464 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  33.49 
 
 
359 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 
323 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.85 
 
 
405 aa  87.8  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  31.43 
 
 
385 aa  87  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.39 
 
 
423 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
727 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 
342 aa  86.7  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  23.52 
 
 
518 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  30.09 
 
 
328 aa  86.3  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30.36 
 
 
423 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  30.53 
 
 
331 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  49.4 
 
 
489 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  32.31 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  23.77 
 
 
446 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  29.05 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  28.39 
 
 
465 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0281  modification methylase (cytosine-specific methyltransferase  39.81 
 
 
520 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  32.52 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3077  DNA-cytosine methyltransferase  40.87 
 
 
517 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.485404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  38.94 
 
 
657 aa  83.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.62 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  28.02 
 
 
437 aa  82.8  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.14 
 
 
362 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
434 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  33.03 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4096  DNA-cytosine methyltransferase  37.27 
 
 
535 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  33.16 
 
 
318 aa  82.4  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.65 
 
 
335 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.7 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  32.06 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  26.69 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.02 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  28.1 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  30.58 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  29.96 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.17 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  29.47 
 
 
454 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  27.23 
 
 
467 aa  79.7  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  30.66 
 
 
412 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  29.39 
 
 
356 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  30.37 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  30.39 
 
 
632 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.07 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  51.25 
 
 
405 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  29.56 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  33.97 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  46.84 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  30.94 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.71 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  28.37 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  29.27 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>