292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2232 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  100 
 
 
405 aa  835    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.97 
 
 
357 aa  143  6e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.24 
 
 
362 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  38.57 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  36.65 
 
 
395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  38.81 
 
 
313 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  38.79 
 
 
313 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  34.03 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  31.01 
 
 
388 aa  117  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  35.56 
 
 
334 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  40.48 
 
 
308 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  31.37 
 
 
488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  39.77 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.22 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  31.69 
 
 
474 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.44 
 
 
328 aa  108  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  32.61 
 
 
418 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  32.61 
 
 
418 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  31.03 
 
 
420 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  36.4 
 
 
389 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  35.14 
 
 
443 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  32.33 
 
 
424 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  31.47 
 
 
446 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  32.61 
 
 
440 aa  104  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  32.61 
 
 
440 aa  104  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  33.19 
 
 
355 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.23 
 
 
375 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  37.63 
 
 
438 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  31.74 
 
 
465 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  26.59 
 
 
698 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  30.18 
 
 
464 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  34.48 
 
 
489 aa  100  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  33.9 
 
 
438 aa  99.4  9e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  32.05 
 
 
345 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  26.22 
 
 
686 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  32.77 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 
689 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  33.95 
 
 
446 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  34.74 
 
 
361 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  34.1 
 
 
323 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  34.55 
 
 
652 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  36.8 
 
 
399 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.63 
 
 
431 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.07 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  29.86 
 
 
468 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  35.38 
 
 
508 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  31.72 
 
 
431 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  30.53 
 
 
434 aa  94  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  35.06 
 
 
283 aa  94  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  33.89 
 
 
325 aa  92.4  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  35.52 
 
 
437 aa  92.4  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  27.92 
 
 
450 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  31.51 
 
 
671 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  29.22 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  35.43 
 
 
662 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  32.77 
 
 
438 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  29.1 
 
 
423 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  38.2 
 
 
385 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  29.67 
 
 
368 aa  92  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  34.03 
 
 
657 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  36.32 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  33.72 
 
 
416 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  33.18 
 
 
468 aa  91.3  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  34.91 
 
 
335 aa  90.5  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  34.86 
 
 
319 aa  90.5  4e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  31.56 
 
 
340 aa  90.5  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.68 
 
 
328 aa  90.5  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  35.94 
 
 
313 aa  89.7  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  32.31 
 
 
365 aa  90.1  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  37.5 
 
 
356 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  33.48 
 
 
434 aa  89  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  29.29 
 
 
371 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  33.77 
 
 
386 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  31.91 
 
 
377 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
462 aa  89.4  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  30.81 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
350 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3077  DNA-cytosine methyltransferase  34.81 
 
 
517 aa  88.6  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.485404  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 
424 aa  87.8  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  29.39 
 
 
305 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  33.63 
 
 
342 aa  86.7  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  31.28 
 
 
361 aa  86.3  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  29.66 
 
 
319 aa  86.3  9e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  29.74 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.09 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  33.33 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  28.63 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0281  modification methylase (cytosine-specific methyltransferase  31.46 
 
 
520 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 
389 aa  84  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  31.23 
 
 
454 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  32.42 
 
 
320 aa  84  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
370 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  31.47 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  31.94 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  33.01 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  36.26 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 
375 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  28.57 
 
 
373 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>