More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3948 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
657 aa  1337    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  34.58 
 
 
489 aa  241  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  32.33 
 
 
474 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  32.1 
 
 
388 aa  206  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  30.22 
 
 
468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.23 
 
 
357 aa  190  5.999999999999999e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  33.42 
 
 
652 aa  180  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  30.96 
 
 
698 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  33.18 
 
 
452 aa  179  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  30.71 
 
 
686 aa  177  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  32.27 
 
 
420 aa  173  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 
689 aa  171  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  32.83 
 
 
671 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  33.42 
 
 
395 aa  163  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  31.31 
 
 
373 aa  160  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 
418 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 
418 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  30.91 
 
 
423 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  30.92 
 
 
389 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  30.58 
 
 
415 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.75 
 
 
434 aa  155  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  30.32 
 
 
500 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  39.44 
 
 
219 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  28.96 
 
 
421 aa  147  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  27.36 
 
 
502 aa  143  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  26.55 
 
 
450 aa  142  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  29.85 
 
 
431 aa  141  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0281  modification methylase (cytosine-specific methyltransferase  26.52 
 
 
520 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3077  DNA-cytosine methyltransferase  27.47 
 
 
517 aa  139  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.485404  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.52 
 
 
446 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  29.85 
 
 
377 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2061  DNA-cytosine methyltransferase  28.02 
 
 
511 aa  137  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.17 
 
 
431 aa  136  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
362 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  30.2 
 
 
361 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  29.87 
 
 
358 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  31.76 
 
 
355 aa  134  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  30.08 
 
 
365 aa  134  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.26 
 
 
375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  28.13 
 
 
488 aa  133  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.33 
 
 
387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  30.57 
 
 
398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.76 
 
 
415 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4264  DNA-cytosine methyltransferase  26.68 
 
 
508 aa  132  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  28.82 
 
 
390 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  33.93 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 
342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 
360 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0980  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.17 
 
 
232 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000905623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.55 
 
 
241 aa  127  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 
446 aa  126  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  30.05 
 
 
440 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4096  DNA-cytosine methyltransferase  25.14 
 
 
535 aa  125  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  29.51 
 
 
365 aa  125  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  28.86 
 
 
352 aa  125  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  30.15 
 
 
443 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  28.22 
 
 
385 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  29.56 
 
 
381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  29.47 
 
 
374 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
340 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  41.67 
 
 
438 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  24.54 
 
 
465 aa  122  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  39.71 
 
 
508 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
361 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  30.31 
 
 
406 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 
345 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  27.98 
 
 
438 aa  117  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.62 
 
 
404 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  25.61 
 
 
362 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  28.28 
 
 
320 aa  114  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  27.52 
 
 
358 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  27.36 
 
 
375 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 
358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  26.62 
 
 
328 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  28.78 
 
 
356 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  28.28 
 
 
423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.38 
 
 
359 aa  112  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.9 
 
 
319 aa  112  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  38.54 
 
 
440 aa  111  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  25.73 
 
 
370 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  38.54 
 
 
440 aa  111  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  28.1 
 
 
423 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 
348 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  25.64 
 
 
406 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.6 
 
 
222 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 
371 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  25.17 
 
 
464 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  27.68 
 
 
354 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 
373 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  27.2 
 
 
313 aa  107  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  29.04 
 
 
371 aa  107  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  27.27 
 
 
344 aa  107  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 
309 aa  106  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 
399 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  28.32 
 
 
366 aa  106  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  29.97 
 
 
318 aa  105  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  29.78 
 
 
454 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  27.34 
 
 
415 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  37.76 
 
 
424 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  28.27 
 
 
434 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>