276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0080 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 371 aa  778    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  54.44 
 
 		 375 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  45.82 
 
 		 342 aa  286  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  43.84 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  38.65 
 
 		 373 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  39.06 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  38.42 
 
 		 358 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  36.71 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  39.72 
 
 		 371 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  35.81 
 
 		 344 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  36.52 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  35.36 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.11 
 
 		 350 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  35.34 
 
 		 366 aa  205  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  35.75 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  35.57 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  34.05 
 
 		 374 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  32.41 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  35.42 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  33.42 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.71 
 
 		 357 aa  166  9e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  31.79 
 
 		 395 aa  159  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  33.15 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  30.87 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  32.44 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30.28 
 
 		 423 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.92 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  33.52 
 
 		 381 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  34.59 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.67 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  29.17 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  30.06 
 
 		 359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  29.61 
 
 		 652 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.69 
 
 		 465 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 		 438 aa  133  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  27.14 
 
 		 689 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  31.69 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30.11 
 
 		 671 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  27.74 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.87 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  29.23 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.55 
 
 		 404 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  28.11 
 
 		 349 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  26.21 
 
 		 698 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  29.13 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 		 474 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  30.08 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  31.35 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  25.95 
 
 		 686 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  29.88 
 
 		 318 aa  123  6e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  28.95 
 
 		 468 aa  123  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.9 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.04 
 
 		 362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  31.1 
 
 		 320 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  29.46 
 
 		 379 aa  119  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  28.9 
 
 		 309 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  29.57 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  27.12 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.42 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  26.65 
 
 		 313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.69 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  27.17 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  25.62 
 
 		 489 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  29.36 
 
 		 355 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  27 
 
 		 488 aa  109  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 		 657 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  28.34 
 
 		 400 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  27.38 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  29.78 
 
 		 342 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.3 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  26.1 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  25.99 
 
 		 421 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  27.35 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  26.99 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  26.3 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  24.37 
 
 		 438 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.1 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  26.68 
 
 		 468 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  26.68 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  26.56 
 
 		 431 aa  96.3  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  26.71 
 
 		 415 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  29.89 
 
 		 358 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  26.69 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 		 440 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 		 440 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  25.92 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  27.44 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.82 
 
 		 431 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  25.71 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  26.28 
 
 		 409 aa  93.6  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  27.47 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  28.1 
 
 		 337 aa  93.2  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  26.74 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  23.68 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>