277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2193 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 358 aa  730    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  55.98 
 
 		 366 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  55.1 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  54.81 
 
 		 349 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  52.27 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  49.85 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  54.71 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  48.85 
 
 		 359 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  50.29 
 
 		 373 aa  352  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  49.43 
 
 		 350 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  46.11 
 
 		 354 aa  332  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  39.42 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  39.34 
 
 		 352 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  38.42 
 
 		 371 aa  225  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  38.82 
 
 		 374 aa  222  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  36.02 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  35.84 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  35.48 
 
 		 362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  31.98 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  34.59 
 
 		 373 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.77 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  31.61 
 
 		 361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  30.05 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.25 
 
 		 404 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  31.87 
 
 		 652 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  29.13 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.41 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 		 359 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  31.69 
 
 		 381 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 		 671 aa  132  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  31.55 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  31.84 
 
 		 434 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  25.61 
 
 		 465 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  31.83 
 
 		 415 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  30.35 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  29.36 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  25.14 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 		 313 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.72 
 
 		 415 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  29.85 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  28.78 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.82 
 
 		 387 aa  116  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  26.58 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  29.15 
 
 		 318 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  27.52 
 
 		 657 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 		 418 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 		 418 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  29.19 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  29.11 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  29.31 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  27.72 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  26.84 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  29.33 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.04 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.17 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  30.28 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  29.13 
 
 		 443 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  27.75 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.09 
 
 		 362 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.42 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  25.54 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  26.14 
 
 		 689 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  28.41 
 
 		 320 aa  99.8  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  27.89 
 
 		 308 aa  99.8  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  30.42 
 
 		 358 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  25.89 
 
 		 686 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  27.46 
 
 		 421 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 		 446 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  25.44 
 
 		 698 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  26.53 
 
 		 334 aa  96.3  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  26.85 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.48 
 
 		 405 aa  94  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  26.33 
 
 		 370 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 		 386 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  27.8 
 
 		 406 aa  93.2  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  25.21 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  27.02 
 
 		 412 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  25.51 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  26.98 
 
 		 313 aa  92.4  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  26.8 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  24.8 
 
 		 355 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  23.85 
 
 		 468 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  35.29 
 
 		 434 aa  89.7  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  24.66 
 
 		 450 aa  89.7  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.61 
 
 		 375 aa  89.4  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  27.75 
 
 		 615 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  24.35 
 
 		 366 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  36.99 
 
 		 424 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  25.13 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  29.09 
 
 		 379 aa  86.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.06 
 
 		 406 aa  86.3  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  25.8 
 
 		 489 aa  85.9  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  29.44 
 
 		 358 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  35.8 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>