More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0700 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 320 aa  652    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  82.11 
 
 		 319 aa  540  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  80.48 
 
 		 313 aa  488  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  77.32 
 
 		 318 aa  486  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  58.39 
 
 		 309 aa  344  1e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  57.51 
 
 		 320 aa  325  5e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  54.4 
 
 		 313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  53.38 
 
 		 325 aa  306  3e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1008  DNA-cytosine methyltransferase  43.54 
 
 		 367 aa  275  8e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  43.75 
 
 		 366 aa  272  7e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  43.75 
 
 		 355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 		 360 aa  178  9e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  34.82 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 		 342 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  31.75 
 
 		 340 aa  155  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  32.33 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  30.59 
 
 		 374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  31.86 
 
 		 364 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  31.96 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.29 
 
 		 357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  31.99 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.86 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 		 373 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  31.27 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  31.98 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  26.7 
 
 		 489 aa  136  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  31.55 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.25 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  29.36 
 
 		 358 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 		 465 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  30.42 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  28.76 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  31.79 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.64 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.25 
 
 		 423 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  29.48 
 
 		 371 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  30.84 
 
 		 349 aa  129  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.3 
 
 		 431 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  29.48 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.78 
 
 		 359 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 		 375 aa  126  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.22 
 
 		 375 aa  125  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  29.94 
 
 		 308 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  26.34 
 
 		 377 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  28.94 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  31.7 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  31.3 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  26.96 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  29.45 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  27.67 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  30.88 
 
 		 365 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  26.95 
 
 		 671 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 356 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  29.77 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  29.23 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  27.68 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  28.46 
 
 		 395 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  29.65 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  31.67 
 
 		 359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  31.69 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.93 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  26.75 
 
 		 388 aa  119  6e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  31.63 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  29.38 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.96 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  29.6 
 
 		 632 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 		 652 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  28.02 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.06 
 
 		 370 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  29.32 
 
 		 434 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  29.92 
 
 		 454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  27.56 
 
 		 431 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  29.76 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  30.59 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  24.78 
 
 		 450 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  27.98 
 
 		 657 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  27.5 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  27.95 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.81 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 		 424 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  26.27 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  28.92 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  28.69 
 
 		 412 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  29.71 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  24.73 
 
 		 358 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.09 
 
 		 362 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  33 
 
 		 443 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.27 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  27.95 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 		 727 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  36.81 
 
 		 283 aa  99.4  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  24.62 
 
 		 402 aa  99.4  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2924  DNA-cytosine methyltransferase  28.41 
 
 		 537 aa  98.6  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  37.21 
 
 		 406 aa  98.6  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.95 
 
 		 397 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  26.7 
 
 		 438 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>