More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1050 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 361 aa  729    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  64.08 
 
 		 349 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  43.55 
 
 		 434 aa  256  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  45.01 
 
 		 399 aa  251  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.26 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  35.68 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  35.95 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  35.41 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  36.51 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  35.15 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  34.58 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  30.94 
 
 		 340 aa  168  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  33.42 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.74 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  30.28 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  33.17 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  34.14 
 
 		 381 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  29.52 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  32.99 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  30.35 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  30.08 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  32.63 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  31.61 
 
 		 358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  30.96 
 
 		 389 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  29.27 
 
 		 406 aa  145  9e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  34.1 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.76 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  35.73 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  30.75 
 
 		 434 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.87 
 
 		 415 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  32.92 
 
 		 443 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  30.98 
 
 		 424 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  33.69 
 
 		 671 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  30.28 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  31.15 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  32 
 
 		 431 aa  139  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  29.78 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  29.78 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.07 
 
 		 359 aa  136  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  30.05 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.11 
 
 		 313 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  30.27 
 
 		 418 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  30.27 
 
 		 418 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  29.97 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  32.79 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  29.4 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  29.56 
 
 		 352 aa  132  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  31.3 
 
 		 365 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 		 438 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 		 488 aa  132  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  28.15 
 
 		 468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  29.38 
 
 		 335 aa  129  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  27.15 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  29.08 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.94 
 
 		 431 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.92 
 
 		 465 aa  125  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  30.14 
 
 		 377 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  29.76 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  29.72 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  31.18 
 
 		 356 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  26.11 
 
 		 489 aa  124  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.59 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.74 
 
 		 404 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 		 348 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.32 
 
 		 375 aa  122  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  32.11 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  29.87 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.6 
 
 		 423 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  26.29 
 
 		 452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.92 
 
 		 362 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  26.1 
 
 		 361 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 474 aa  119  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 		 657 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  37.2 
 
 		 310 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  39.67 
 
 		 283 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  30.23 
 
 		 652 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  30.28 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 		 423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.41 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  31.44 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.74 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  30.4 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  28.77 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  31.73 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  26.63 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  34.34 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  31.22 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  25.96 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  29.48 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  32.46 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  30.57 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 		 320 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>