281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4678 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
345 aa  721    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  55.23 
 
 
366 aa  418  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  55.49 
 
 
344 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  55.23 
 
 
349 aa  411  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  57.6 
 
 
371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  54.23 
 
 
355 aa  394  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  54.49 
 
 
354 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  49.85 
 
 
358 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  51.15 
 
 
350 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  49.56 
 
 
373 aa  364  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  51.3 
 
 
359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  42.57 
 
 
352 aa  257  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  37.22 
 
 
375 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  34.01 
 
 
342 aa  229  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  36.71 
 
 
371 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  36.44 
 
 
374 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  36.34 
 
 
340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  34.29 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  36.34 
 
 
365 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.78 
 
 
373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  34.51 
 
 
359 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.59 
 
 
357 aa  149  5e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.13 
 
 
404 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  27.15 
 
 
361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 
319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  26.17 
 
 
395 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  26.37 
 
 
465 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.84 
 
 
360 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  27.84 
 
 
385 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 
657 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
399 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  26.52 
 
 
398 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.74 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 
389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.73 
 
 
397 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
423 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  25.87 
 
 
488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  29.67 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.73 
 
 
415 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  26.72 
 
 
438 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  28.19 
 
 
434 aa  109  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 
415 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  28.53 
 
 
468 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  25.93 
 
 
652 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  25.3 
 
 
320 aa  104  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  25.36 
 
 
318 aa  103  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
355 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  25.61 
 
 
313 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  27.35 
 
 
358 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  28.25 
 
 
364 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  27.92 
 
 
325 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  26.33 
 
 
361 aa  99.8  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  26.29 
 
 
489 aa  99.8  7e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  28.88 
 
 
390 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  23.73 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  26.53 
 
 
313 aa  98.6  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  26.96 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 
421 aa  96.3  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  23.98 
 
 
370 aa  95.9  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  24.93 
 
 
365 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  25.85 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  25.59 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  27.7 
 
 
615 aa  94.4  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  26.09 
 
 
443 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  26.11 
 
 
446 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
328 aa  93.6  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  26.05 
 
 
335 aa  93.6  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 
406 aa  93.2  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  34.24 
 
 
418 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  34.24 
 
 
418 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 
671 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.43 
 
 
431 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  24 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  26.61 
 
 
474 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.25 
 
 
362 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  26.92 
 
 
412 aa  89.7  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.27 
 
 
375 aa  89.4  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  25.61 
 
 
429 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  25.21 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  25.57 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  26.88 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  25 
 
 
450 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  24.79 
 
 
358 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  25.44 
 
 
689 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
434 aa  87  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.9 
 
 
405 aa  86.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  25.65 
 
 
334 aa  86.7  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  25.77 
 
 
468 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  25.29 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  25.93 
 
 
727 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  24.75 
 
 
686 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  26.07 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  32.58 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  32.58 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  24.75 
 
 
395 aa  84  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  24.75 
 
 
698 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>