More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2280 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 313 aa  635    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  63.14 
 
 		 325 aa  417  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  53.27 
 
 		 319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  52.23 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  53.74 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  51.63 
 
 		 309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  52.92 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  52.94 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  38.59 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  38.4 
 
 		 355 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1008  DNA-cytosine methyltransferase  37.18 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  34.14 
 
 		 415 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  30.93 
 
 		 418 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  30.93 
 
 		 418 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.82 
 
 		 431 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  30.1 
 
 		 421 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  31.56 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  31.46 
 
 		 434 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.19 
 
 		 357 aa  149  7e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  29.01 
 
 		 360 aa  149  9e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  29.76 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 390 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  29.31 
 
 		 395 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  30.68 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  32.15 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  32.14 
 
 		 400 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  29.41 
 
 		 431 aa  133  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  31.56 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  30.41 
 
 		 340 aa  132  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.99 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  29.68 
 
 		 362 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  29.64 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.04 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  31.07 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  28.09 
 
 		 446 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  29.48 
 
 		 381 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  30.5 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  29.31 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  27.45 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  26.78 
 
 		 370 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  27.46 
 
 		 352 aa  123  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  28.05 
 
 		 374 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  32.32 
 
 		 489 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.84 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  27.06 
 
 		 423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.81 
 
 		 415 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  28.06 
 
 		 389 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 		 365 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  28.14 
 
 		 423 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  28.35 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.21 
 
 		 405 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  31.95 
 
 		 365 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  27.49 
 
 		 468 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  28.9 
 
 		 398 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  26.44 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  27.53 
 
 		 388 aa  112  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 		 652 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  29.05 
 
 		 358 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  26.2 
 
 		 454 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  31.31 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  29.23 
 
 		 632 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  26.33 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  29.3 
 
 		 368 aa  109  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.22 
 
 		 359 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  25.64 
 
 		 373 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  27.83 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.95 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  28.93 
 
 		 412 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  25.41 
 
 		 671 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  34.42 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  27.38 
 
 		 371 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  25.95 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 385 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  27.47 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  34.52 
 
 		 283 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  26.11 
 
 		 474 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  28.28 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  26.84 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  29.03 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  28.86 
 
 		 323 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  28.44 
 
 		 662 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  26.53 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3182  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.69 
 
 		 495 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  27.39 
 
 		 434 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  25.59 
 
 		 468 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  26.72 
 
 		 355 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  29.15 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  27.71 
 
 		 348 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  28.49 
 
 		 364 aa  97.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.55 
 
 		 387 aa  97.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  27.19 
 
 		 334 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  25.73 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  28.14 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 		 424 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  28.08 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  26.9 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  29.54 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>