244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1008 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  93.22 
 
 
355 aa  671    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  92.88 
 
 
366 aa  694    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1008  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
367 aa  741    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  43.65 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  41.78 
 
 
319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  41.67 
 
 
313 aa  256  4e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  42.94 
 
 
320 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  41.27 
 
 
325 aa  250  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  44.96 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  38.31 
 
 
309 aa  230  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  37.18 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.48 
 
 
360 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  27.03 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  26.09 
 
 
340 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  24.69 
 
 
365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  26.07 
 
 
398 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  28.11 
 
 
489 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  24.82 
 
 
388 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  26.75 
 
 
365 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  24.15 
 
 
361 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  25.67 
 
 
373 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  24.52 
 
 
465 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  27.74 
 
 
423 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  24.13 
 
 
443 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  25.41 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.57 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  22.62 
 
 
387 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  22.66 
 
 
423 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  24.55 
 
 
362 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  24.94 
 
 
468 aa  92.8  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  24.14 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.25 
 
 
415 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  27.5 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  24.09 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  25.38 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  22.9 
 
 
400 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  22.38 
 
 
362 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  22.4 
 
 
423 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  22.65 
 
 
381 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  24.2 
 
 
371 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  23.36 
 
 
342 aa  89.7  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  27.87 
 
 
508 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  24.62 
 
 
328 aa  89.4  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  26.71 
 
 
355 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  22.55 
 
 
375 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  24 
 
 
313 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  28.98 
 
 
450 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  24.68 
 
 
662 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  23.17 
 
 
374 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  27.5 
 
 
500 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  23.02 
 
 
361 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.5 
 
 
405 aa  86.3  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  22.06 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  23.98 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  23.66 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.15 
 
 
488 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  23.13 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  23.19 
 
 
390 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  22.94 
 
 
358 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  21.55 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  23.04 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  22.73 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.13 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  27.1 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  27.94 
 
 
468 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  26.85 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.65 
 
 
446 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  26.42 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  23.61 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  26.84 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  23.32 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  24.32 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  25.57 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  22.77 
 
 
632 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  23.69 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  24.53 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  21.76 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  23.1 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  21.93 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  22.66 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  21.03 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.37 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2924  DNA-cytosine methyltransferase  25.51 
 
 
537 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 
446 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.69 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3077  DNA-cytosine methyltransferase  29.58 
 
 
517 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.485404  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  23.14 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  20.63 
 
 
454 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  19.7 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  25.61 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  23.22 
 
 
657 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  22.85 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 
418 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 
418 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  27.13 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  23.24 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  25.81 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>