279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2163 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  100 
 
 		 375 aa  771    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  52.97 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  46.7 
 
 		 361 aa  318  9e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  46.3 
 
 		 365 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  46.43 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  46.95 
 
 		 358 aa  301  9e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  38.58 
 
 		 415 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  42.22 
 
 		 431 aa  248  9e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  37.82 
 
 		 434 aa  246  6e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  36.81 
 
 		 421 aa  236  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.66 
 
 		 431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  37.3 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  37.3 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  35.08 
 
 		 446 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  35.81 
 
 		 443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.96 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  31.9 
 
 		 381 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.36 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  32.73 
 
 		 671 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  30.46 
 
 		 652 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  30.26 
 
 		 657 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  30.87 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  27.63 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.91 
 
 		 387 aa  129  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  29.63 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  30.81 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.08 
 
 		 319 aa  126  5e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  28.61 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  31.12 
 
 		 365 aa  123  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  25.23 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  31.32 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  29.03 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  28.3 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  26.85 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  28.91 
 
 		 698 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  28.51 
 
 		 488 aa  115  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  26.08 
 
 		 438 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  27.06 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 		 686 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  30.14 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  27.6 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  26.72 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  26.34 
 
 		 489 aa  114  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 		 348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  28.15 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  28.87 
 
 		 424 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  25.8 
 
 		 395 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  26.27 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.11 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  29.04 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  28.28 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  26.95 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  26.2 
 
 		 352 aa  109  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  28.73 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  27.73 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  29.86 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  26.48 
 
 		 452 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  28.57 
 
 		 364 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  27.22 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 		 318 aa  106  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  27.79 
 
 		 689 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  33.99 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  28.46 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  28.77 
 
 		 518 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  27.22 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.03 
 
 		 370 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  26.65 
 
 		 492 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.23 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  26.18 
 
 		 361 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1494  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  28.04 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  37.29 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  26.91 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  26.91 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 		 465 aa  99.8  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  33.53 
 
 		 335 aa  99.4  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.46 
 
 		 362 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  27.1 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  25.12 
 
 		 450 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  28.13 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  35.44 
 
 		 508 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  28.22 
 
 		 355 aa  96.7  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  26.53 
 
 		 359 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 		 323 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  26.47 
 
 		 349 aa  95.9  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  25.87 
 
 		 474 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  33.49 
 
 		 313 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  23.98 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  33.14 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  24.85 
 
 		 415 aa  93.2  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.65 
 
 		 404 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>