More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4973 on replicon NC_008762
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 373 aa  765    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  55.81 
 
 		 344 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  53.78 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  53.33 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  54.97 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  49.56 
 
 		 345 aa  364  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  51.25 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  48.98 
 
 		 359 aa  352  5e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  50.29 
 
 		 358 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  50.29 
 
 		 350 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  48.08 
 
 		 354 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  40.58 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  40.69 
 
 		 352 aa  256  6e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  39.84 
 
 		 375 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  38.65 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  38.55 
 
 		 374 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  37.96 
 
 		 365 aa  219  5e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  34.77 
 
 		 340 aa  209  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  36 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  34.76 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  32.73 
 
 		 395 aa  159  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.34 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  32.47 
 
 		 398 aa  149  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 		 319 aa  149  9e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  29.64 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  34.78 
 
 		 381 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  29.97 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  32.61 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  28.86 
 
 		 385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.9 
 
 		 387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  28.74 
 
 		 313 aa  132  9e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.64 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  24.8 
 
 		 360 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.04 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  29.52 
 
 		 652 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.69 
 
 		 465 aa  126  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  29.12 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  29.21 
 
 		 310 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  30.53 
 
 		 361 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 		 671 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  31.08 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  27.33 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  29.44 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  26.75 
 
 		 370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  30.25 
 
 		 308 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.9 
 
 		 397 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.33 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  23.38 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  27.73 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  30.21 
 
 		 431 aa  116  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  29.29 
 
 		 358 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  29.78 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  25.87 
 
 		 313 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  29.08 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 		 309 aa  113  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  29.95 
 
 		 424 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.44 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  27.82 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  26.01 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  27.44 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.3 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  25.42 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  25.64 
 
 		 313 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  26.98 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  26.99 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 		 657 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.88 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  29.48 
 
 		 615 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  23.67 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  26.78 
 
 		 364 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.86 
 
 		 488 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  27.4 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  26.33 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 		 434 aa  103  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  26.4 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  33.8 
 
 		 452 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  25.06 
 
 		 689 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  23.88 
 
 		 489 aa  99.8  7e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.39 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.84 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  26.41 
 
 		 415 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  27.93 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  27.5 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  27.82 
 
 		 438 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.65 
 
 		 328 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  27.95 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  23.81 
 
 		 686 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 		 446 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  23.57 
 
 		 698 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  23.58 
 
 		 468 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  25.59 
 
 		 348 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  26.21 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  27.06 
 
 		 443 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  27.12 
 
 		 632 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>