276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1333 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
415 aa  873    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  34.14 
 
 
355 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  31.92 
 
 
360 aa  173  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  30.27 
 
 
388 aa  161  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  28.88 
 
 
373 aa  159  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  29.13 
 
 
415 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  28.98 
 
 
418 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  28.98 
 
 
418 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  30.5 
 
 
395 aa  153  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  30.59 
 
 
474 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.29 
 
 
387 aa  150  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.57 
 
 
357 aa  150  5e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  28.68 
 
 
390 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.17 
 
 
431 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  27.39 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.94 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 
652 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  29.06 
 
 
421 aa  146  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  30.27 
 
 
468 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  28.48 
 
 
446 aa  143  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  27.7 
 
 
381 aa  143  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  28.3 
 
 
489 aa  137  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  29.17 
 
 
434 aa  136  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  27.1 
 
 
671 aa  135  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  27.05 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  28.01 
 
 
468 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  28.04 
 
 
389 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  26.24 
 
 
440 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  26.24 
 
 
440 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  27.61 
 
 
313 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  27.41 
 
 
365 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  27.21 
 
 
362 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 
488 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  25.75 
 
 
319 aa  124  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  26.15 
 
 
398 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  26 
 
 
686 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  26.74 
 
 
452 aa  123  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 
446 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  27.57 
 
 
689 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  27.75 
 
 
440 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  26.78 
 
 
698 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  26 
 
 
462 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  27.94 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  27.34 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  25.06 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  26.38 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  27.38 
 
 
518 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  27.47 
 
 
399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.88 
 
 
362 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  29.15 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.3 
 
 
657 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  26.25 
 
 
323 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  25.71 
 
 
431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 
423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  25.52 
 
 
464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1494  DNA-cytosine methyltransferase  26.57 
 
 
423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  26.62 
 
 
370 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  26.37 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.27 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  26.11 
 
 
361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.04 
 
 
406 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  27.41 
 
 
365 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  24.24 
 
 
438 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  26.24 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  24.63 
 
 
325 aa  111  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
508 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 
386 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  27.05 
 
 
373 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  27.41 
 
 
399 aa  109  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  25.37 
 
 
438 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  25.86 
 
 
318 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  24.59 
 
 
349 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  24.3 
 
 
409 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  25.46 
 
 
393 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  23.33 
 
 
342 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.37 
 
 
362 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0281  modification methylase (cytosine-specific methyltransferase  25.1 
 
 
520 aa  106  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  25.44 
 
 
337 aa  106  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  26.07 
 
 
364 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  25.51 
 
 
374 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  24.38 
 
 
313 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  24.19 
 
 
309 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  25.58 
 
 
371 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.18 
 
 
375 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  27.14 
 
 
370 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  27.12 
 
 
379 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  27.36 
 
 
429 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  24.01 
 
 
313 aa  103  5e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  26.14 
 
 
361 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 
435 aa  102  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  24.07 
 
 
356 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  24.25 
 
 
313 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  23.6 
 
 
320 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
340 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  24.46 
 
 
366 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  26.84 
 
 
434 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  24.21 
 
 
354 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>