275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0824 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
349 aa  718    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  64.08 
 
 
361 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  41.98 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  41.76 
 
 
399 aa  228  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  35.03 
 
 
374 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.83 
 
 
357 aa  165  9e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  32.79 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  31.47 
 
 
385 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.18 
 
 
387 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  29.64 
 
 
340 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  30.89 
 
 
395 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  28.79 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  32.84 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  32.24 
 
 
365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  30.49 
 
 
406 aa  127  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  28.11 
 
 
371 aa  126  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  31.22 
 
 
362 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  28.23 
 
 
375 aa  123  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  30.47 
 
 
313 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  29.64 
 
 
421 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  28.14 
 
 
488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  31.49 
 
 
344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  29.95 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  29.87 
 
 
381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  29.46 
 
 
468 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  30.03 
 
 
308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 
415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  31.33 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.76 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  27.16 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  28.03 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  26.51 
 
 
465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  30.03 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  27.82 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  28.87 
 
 
443 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.13 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  27.92 
 
 
368 aa  110  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.07 
 
 
405 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  30.25 
 
 
412 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  29.33 
 
 
358 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.1 
 
 
359 aa  105  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  26.7 
 
 
389 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  25.27 
 
 
360 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  31.21 
 
 
355 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  25.98 
 
 
361 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.68 
 
 
362 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  25.8 
 
 
468 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 
355 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.56 
 
 
431 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  29.22 
 
 
359 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  26.56 
 
 
325 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  27.12 
 
 
365 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  28.64 
 
 
431 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  25.33 
 
 
438 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  28.09 
 
 
409 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 
371 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  29.01 
 
 
446 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.24 
 
 
657 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 
418 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 
418 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.53 
 
 
370 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  25.89 
 
 
440 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  32.99 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  28.98 
 
 
671 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  36.05 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  25.89 
 
 
440 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.48 
 
 
328 aa  97.1  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  23.37 
 
 
689 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  37.08 
 
 
345 aa  96.3  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  32.45 
 
 
334 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.08 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  27 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  27.39 
 
 
361 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  23.86 
 
 
446 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  28.14 
 
 
358 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.11 
 
 
362 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  25.35 
 
 
323 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  25.96 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.97 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  28.92 
 
 
652 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  26.49 
 
 
415 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  27.4 
 
 
438 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  28.3 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  22.78 
 
 
686 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  28.62 
 
 
420 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  23.04 
 
 
698 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  26.12 
 
 
423 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  25.65 
 
 
474 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  26.33 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  26.46 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.01 
 
 
312 aa  87  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  24.83 
 
 
452 aa  87.4  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  24.54 
 
 
450 aa  86.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  23.51 
 
 
489 aa  86.7  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
508 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.12 
 
 
375 aa  86.7  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>