290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2535 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 400 aa  818    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.16 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  32.29 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  30.06 
 
 		 325 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  31.99 
 
 		 414 aa  140  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  30.29 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.51 
 
 		 423 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30.79 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.96 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  32.76 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  32.74 
 
 		 308 aa  133  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  32.14 
 
 		 313 aa  133  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.79 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  29.86 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  32.23 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  31.55 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.33 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  29.94 
 
 		 632 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  29.77 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  29.46 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  30.16 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  29.81 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  29.94 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  30.7 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  30.82 
 
 		 310 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  31.16 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 		 671 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  29.05 
 
 		 368 aa  123  6e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  25.99 
 
 		 360 aa  122  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  28.69 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  29.89 
 
 		 370 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.93 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  30.03 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.26 
 
 		 357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 		 361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  30.37 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  29.1 
 
 		 652 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.88 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  27.93 
 
 		 335 aa  117  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  29.41 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  29.84 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  29.88 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  29.23 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  27.7 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 		 662 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  26.42 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.69 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.92 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  27.92 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  29.97 
 
 		 318 aa  111  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  29.24 
 
 		 340 aa  110  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 		 416 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  34.76 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  31.44 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.07 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  28.34 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  25.13 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  29.62 
 
 		 352 aa  106  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  29.61 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  24.43 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.64 
 
 		 418 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  27.3 
 
 		 468 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  29.3 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  26.53 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.79 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  27.82 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  28.88 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  25.71 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  23.6 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  27.91 
 
 		 315 aa  101  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  27.72 
 
 		 358 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.76 
 
 		 431 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  27.72 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  32.06 
 
 		 355 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  24.61 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.17 
 
 		 359 aa  100  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  34.33 
 
 		 472 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  33.07 
 
 		 318 aa  99.8  8e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  34.33 
 
 		 472 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0382129 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  34.33 
 
 		 472 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  34.33 
 
 		 472 aa  99.4  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  34.33 
 
 		 472 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  34.33 
 
 		 472 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  34.33 
 
 		 472 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  30.31 
 
 		 313 aa  99.8  9e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  28.82 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  33.69 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  24.6 
 
 		 438 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  29.49 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  34.33 
 
 		 476 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>