More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1616 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  100 
 
 
345 aa  717    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  73.51 
 
 
313 aa  475  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  45.62 
 
 
368 aa  268  8e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  37.65 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  39.81 
 
 
313 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  37.81 
 
 
313 aa  199  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  39.94 
 
 
379 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  37.06 
 
 
308 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  35.4 
 
 
328 aa  180  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  35.33 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  36.22 
 
 
334 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  33.92 
 
 
335 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  32.98 
 
 
398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  43.92 
 
 
406 aa  161  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  34.84 
 
 
399 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.02 
 
 
328 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.48 
 
 
395 aa  157  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  33.72 
 
 
370 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  33.43 
 
 
335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  32.48 
 
 
400 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  33.05 
 
 
386 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  31.89 
 
 
337 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  31.94 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 
438 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  33.75 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  32.98 
 
 
434 aa  139  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  31.28 
 
 
468 aa  133  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.18 
 
 
373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 
416 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  30.65 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.43 
 
 
350 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
412 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 
423 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  28.14 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1749  DNA-cytosine methyltransferase  31.75 
 
 
350 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000535565  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  37.23 
 
 
319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  27.81 
 
 
727 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  28.99 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  27.81 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
398 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.68 
 
 
357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  29.8 
 
 
342 aa  119  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  29.7 
 
 
657 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 
331 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.71 
 
 
405 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.17 
 
 
387 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 
416 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  27.51 
 
 
417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  27.13 
 
 
329 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  28.35 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  30.2 
 
 
438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  25.9 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  28.35 
 
 
305 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  30.2 
 
 
406 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  28.05 
 
 
327 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 
409 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  29.61 
 
 
495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  24.93 
 
 
390 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 
465 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  30.67 
 
 
359 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 
632 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  26.38 
 
 
402 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  30.3 
 
 
615 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 
370 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  30.94 
 
 
456 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  30.94 
 
 
456 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  31.82 
 
 
312 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
429 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  30.38 
 
 
356 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  27.16 
 
 
440 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  30.37 
 
 
417 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  30.75 
 
 
318 aa  106  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.65 
 
 
362 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  24.24 
 
 
311 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  29.38 
 
 
662 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  27.66 
 
 
385 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  29.22 
 
 
414 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  26.25 
 
 
388 aa  104  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  29.34 
 
 
427 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  32.64 
 
 
460 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  25.7 
 
 
329 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  32.64 
 
 
460 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  32.75 
 
 
413 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
395 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  28.49 
 
 
364 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  29.39 
 
 
381 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 
671 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.74 
 
 
362 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  39.89 
 
 
283 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  26.84 
 
 
354 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.24 
 
 
359 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  26.49 
 
 
361 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  31.05 
 
 
489 aa  100  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  29.3 
 
 
352 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.77 
 
 
431 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  28.02 
 
 
373 aa  99.4  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  30.1 
 
 
350 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.05 
 
 
405 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>