292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_04331 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  96.12 
 
 		 686 aa  1325    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 698 aa  1445    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  82.79 
 
 		 689 aa  1168    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  37.42 
 
 		 671 aa  313  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  36.9 
 
 		 652 aa  303  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  30.96 
 
 		 657 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 		 452 aa  169  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  29.83 
 
 		 500 aa  164  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  28.12 
 
 		 373 aa  158  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  29 
 
 		 492 aa  157  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.7 
 
 		 501 aa  155  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.45 
 
 		 357 aa  152  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  31.48 
 
 		 418 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  31.48 
 
 		 418 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  28.35 
 
 		 508 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  32.67 
 
 		 415 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  29.58 
 
 		 489 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  29.2 
 
 		 468 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  30.33 
 
 		 388 aa  146  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  28.11 
 
 		 424 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  30.79 
 
 		 474 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.64 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  27.08 
 
 		 395 aa  140  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.78 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  28.15 
 
 		 421 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  26.7 
 
 		 434 aa  132  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  28.28 
 
 		 440 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  28.28 
 
 		 440 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  28.34 
 
 		 423 aa  128  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  29.59 
 
 		 385 aa  127  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.78 
 
 		 488 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  26.21 
 
 		 371 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 		 389 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 		 342 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  27 
 
 		 431 aa  124  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  27.53 
 
 		 464 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  26.12 
 
 		 406 aa  124  8e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  23.89 
 
 		 502 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.54 
 
 		 405 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  25.43 
 
 		 450 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 		 438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  25.48 
 
 		 399 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.57 
 
 		 415 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  28.22 
 
 		 440 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  25.66 
 
 		 361 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.91 
 
 		 375 aa  116  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  25.18 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  23.98 
 
 		 423 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  34.23 
 
 		 334 aa  115  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 		 325 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  25.91 
 
 		 443 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  27.03 
 
 		 375 aa  114  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 		 420 aa  114  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.06 
 
 		 310 aa  113  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  24.38 
 
 		 465 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0281  modification methylase (cytosine-specific methyltransferase  25.65 
 
 		 520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  25.74 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  27.18 
 
 		 361 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3077  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.485404  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  23.92 
 
 		 423 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  24.7 
 
 		 362 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  27.63 
 
 		 358 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 		 415 aa  110  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  26.6 
 
 		 340 aa  110  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  25.85 
 
 		 368 aa  108  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  27.5 
 
 		 374 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 		 412 aa  108  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  27.03 
 
 		 390 aa  108  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1494  DNA-cytosine methyltransferase  29.78 
 
 		 423 aa  107  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  29.28 
 
 		 313 aa  107  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  26.19 
 
 		 362 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  27.06 
 
 		 468 aa  105  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  26.77 
 
 		 518 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  27.48 
 
 		 377 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  25.84 
 
 		 364 aa  103  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  28.32 
 
 		 323 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  26.9 
 
 		 434 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  28.27 
 
 		 381 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.39 
 
 		 397 aa  103  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  31.94 
 
 		 308 aa  103  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  26.56 
 
 		 365 aa  102  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  23.9 
 
 		 404 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  23.96 
 
 		 446 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.59 
 
 		 405 aa  101  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  25.74 
 
 		 335 aa  100  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  24.42 
 
 		 462 aa  100  8e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  26.46 
 
 		 438 aa  100  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.18 
 
 		 362 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 		 355 aa  99  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4096  DNA-cytosine methyltransferase  23.97 
 
 		 535 aa  98.2  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  25.89 
 
 		 358 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  25.19 
 
 		 379 aa  98.2  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  27.22 
 
 		 365 aa  97.8  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.25 
 
 		 350 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.44 
 
 		 359 aa  97.4  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  24.69 
 
 		 355 aa  97.4  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  24.13 
 
 		 328 aa  97.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  23.14 
 
 		 361 aa  96.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  26.9 
 
 		 318 aa  97.1  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>