284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1494 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1494  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
423 aa  872    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  45.61 
 
 
464 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  44.55 
 
 
518 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  45.82 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  43.87 
 
 
434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  38.08 
 
 
440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  31.1 
 
 
671 aa  140  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  27.74 
 
 
450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  29.73 
 
 
361 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  29.02 
 
 
468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.36 
 
 
357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  27.17 
 
 
388 aa  126  6e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.84 
 
 
431 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  26.96 
 
 
415 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  31.28 
 
 
395 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  30.07 
 
 
377 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.24 
 
 
434 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  29.93 
 
 
686 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  29.65 
 
 
438 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.86 
 
 
446 aa  123  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  29.78 
 
 
440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  29.78 
 
 
440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 
424 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  29.71 
 
 
698 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  26.85 
 
 
421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  28.47 
 
 
652 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  27.78 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 
415 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.71 
 
 
387 aa  117  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  27.84 
 
 
492 aa  117  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.68 
 
 
375 aa  117  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 
390 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  27.6 
 
 
418 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.6 
 
 
418 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  28.47 
 
 
689 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  27.95 
 
 
398 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.03 
 
 
415 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  26.23 
 
 
360 aa  109  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  27.53 
 
 
389 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  27.44 
 
 
657 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 
500 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  27.39 
 
 
379 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  34.57 
 
 
283 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  29.44 
 
 
358 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  26.82 
 
 
446 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0401  C-5 cytosine-specific DNA methylase  53.76 
 
 
520 aa  103  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.428624  hitchhiker  0.000124126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  24.31 
 
 
431 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  34.63 
 
 
348 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  27.97 
 
 
358 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  27.38 
 
 
423 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00245  site-specific DNA-methyltransferase  31.39 
 
 
735 aa  100  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.191981  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
365 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  26.15 
 
 
362 aa  99.8  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  25.88 
 
 
365 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  35.33 
 
 
361 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  26.79 
 
 
420 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  33.48 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  27.68 
 
 
468 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
488 aa  98.2  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  34.45 
 
 
429 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  35.07 
 
 
508 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  24.82 
 
 
474 aa  96.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 
370 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00287  probable C-5 cytosine-specific DNA methylase  50 
 
 
113 aa  93.6  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  34.54 
 
 
356 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.27 
 
 
405 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  31.63 
 
 
489 aa  90.9  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  32.49 
 
 
657 aa  90.5  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  31.78 
 
 
443 aa  89.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  24.39 
 
 
323 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  27.13 
 
 
355 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  23.45 
 
 
465 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  31.86 
 
 
452 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  31.53 
 
 
362 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.19 
 
 
405 aa  88.2  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  33.86 
 
 
374 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  26.48 
 
 
335 aa  86.7  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  24.37 
 
 
319 aa  86.3  9e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2061  DNA-cytosine methyltransferase  24.66 
 
 
511 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  26.23 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  25.83 
 
 
342 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  32.16 
 
 
437 aa  84  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  34.41 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  25.3 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  24.71 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3077  DNA-cytosine methyltransferase  25.25 
 
 
517 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.485404  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  31.55 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  31.79 
 
 
342 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  26.95 
 
 
328 aa  82  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  35.68 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.33 
 
 
451 aa  80.9  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.02 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.55 
 
 
501 aa  80.5  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  25.76 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  24.52 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  32.45 
 
 
632 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  31.58 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>