More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0598 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 440 aa  904    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 440 aa  904    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  68.5 
 
 		 438 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  46.48 
 
 		 424 aa  347  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  32.17 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  33.49 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.59 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  30.42 
 
 		 488 aa  157  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  31.67 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 		 342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  31.48 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.29 
 
 		 418 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  29.29 
 
 		 418 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  31.75 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  30.96 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  29.45 
 
 		 671 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  28.92 
 
 		 652 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.93 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  41.86 
 
 		 489 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  29.05 
 
 		 474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.12 
 
 		 360 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  30.31 
 
 		 355 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 		 686 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.15 
 
 		 415 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  28.28 
 
 		 698 aa  130  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  26.85 
 
 		 689 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  29.57 
 
 		 313 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  25.73 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  27.1 
 
 		 468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  26.53 
 
 		 468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.03 
 
 		 501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  27.46 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  38.01 
 
 		 421 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  40.7 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  25.45 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  38.3 
 
 		 452 aa  116  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 		 415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  27.94 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  41.18 
 
 		 313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  28.03 
 
 		 492 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  38.46 
 
 		 443 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  25.71 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  34.54 
 
 		 320 aa  113  9e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  36.6 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  30.86 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  27.48 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  27.17 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  28.76 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  38.54 
 
 		 657 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 		 464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  36.31 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  33.51 
 
 		 328 aa  110  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  27.42 
 
 		 361 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  34.29 
 
 		 365 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  34.91 
 
 		 340 aa  109  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  40.91 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  29.61 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  39.41 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.11 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  27.45 
 
 		 423 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  36.41 
 
 		 406 aa  108  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  37.97 
 
 		 283 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  28.27 
 
 		 358 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1494  DNA-cytosine methyltransferase  29.78 
 
 		 423 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  26.58 
 
 		 362 aa  106  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  27.68 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  34.67 
 
 		 508 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  33.88 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.61 
 
 		 405 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  25.51 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  34.62 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.11 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  33.15 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.91 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  36.63 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  28.82 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  25.39 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  25.89 
 
 		 349 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  33.16 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  30.51 
 
 		 319 aa  97.1  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  24.52 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  25.33 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  24.83 
 
 		 465 aa  95.5  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.39 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  33.72 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  36.87 
 
 		 317 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  36.71 
 
 		 462 aa  94  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  37.71 
 
 		 356 aa  94  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  34.46 
 
 		 364 aa  93.6  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  25.45 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  35.23 
 
 		 381 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>