More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0450 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
452 aa  936    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  33.26 
 
 
671 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  32.73 
 
 
657 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  29.46 
 
 
388 aa  178  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  29.74 
 
 
698 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 
686 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  29.12 
 
 
420 aa  167  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 
389 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  31.05 
 
 
652 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  29.32 
 
 
689 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  31.42 
 
 
395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  28.89 
 
 
468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  28.83 
 
 
489 aa  162  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  29.91 
 
 
474 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  30.22 
 
 
500 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  30.1 
 
 
492 aa  159  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3077  DNA-cytosine methyltransferase  29.38 
 
 
517 aa  157  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.485404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4264  DNA-cytosine methyltransferase  28.6 
 
 
508 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.19 
 
 
501 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2061  DNA-cytosine methyltransferase  29.8 
 
 
511 aa  153  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4096  DNA-cytosine methyltransferase  27.34 
 
 
535 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  27.79 
 
 
421 aa  146  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 
502 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.26 
 
 
431 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  28.23 
 
 
488 aa  137  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  30.33 
 
 
424 aa  136  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  27.65 
 
 
390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  25.51 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.78 
 
 
446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
328 aa  130  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  25.23 
 
 
313 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  39.11 
 
 
508 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  29.18 
 
 
385 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  26.86 
 
 
406 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  37.31 
 
 
406 aa  123  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  38.86 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  39.69 
 
 
438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  26.29 
 
 
361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.24 
 
 
362 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 
434 aa  117  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  38.3 
 
 
440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  38.3 
 
 
440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  25.91 
 
 
352 aa  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  27.63 
 
 
415 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  38.07 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.13 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  26.71 
 
 
412 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  35.71 
 
 
365 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.48 
 
 
375 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.68 
 
 
357 aa  107  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0281  modification methylase (cytosine-specific methyltransferase  42.14 
 
 
520 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  35.11 
 
 
334 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  36.5 
 
 
361 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  31.61 
 
 
468 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  25.93 
 
 
440 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  24.32 
 
 
465 aa  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 
355 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  32.3 
 
 
434 aa  103  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  34.11 
 
 
373 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  33.03 
 
 
443 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  31.18 
 
 
283 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  33.16 
 
 
340 aa  102  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  32.83 
 
 
431 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  33.51 
 
 
313 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  33.51 
 
 
308 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  27 
 
 
358 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.84 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  33.69 
 
 
310 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  31.53 
 
 
454 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  27.03 
 
 
435 aa  97.1  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  26.54 
 
 
374 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  35.08 
 
 
632 aa  97.1  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  24.89 
 
 
419 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  31.94 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  26.08 
 
 
375 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  32.98 
 
 
335 aa  94.4  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 
446 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.84 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  32.11 
 
 
437 aa  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  32.55 
 
 
366 aa  92  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.43 
 
 
451 aa  91.3  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  32.62 
 
 
379 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  33.16 
 
 
361 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.37 
 
 
405 aa  90.1  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  30.53 
 
 
323 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  27.55 
 
 
386 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  34.31 
 
 
323 aa  89  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  27.56 
 
 
395 aa  89  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  31.94 
 
 
348 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  32.31 
 
 
429 aa  88.2  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  30.36 
 
 
358 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  31.02 
 
 
416 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  31.12 
 
 
657 aa  87.8  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  41.04 
 
 
423 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  24.83 
 
 
349 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  29.63 
 
 
425 aa  87.4  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  29.56 
 
 
460 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>