279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2797 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 399 aa  823    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  62.81 
 
 		 434 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  45.01 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  41.76 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.25 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  34.84 
 
 		 345 aa  159  7e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  31.59 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  32.01 
 
 		 362 aa  143  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  31.22 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  33.69 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  30.48 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  30.15 
 
 		 395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  32.88 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.04 
 
 		 387 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  31.48 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  31.57 
 
 		 389 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  31.39 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  30.58 
 
 		 468 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  32.26 
 
 		 671 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  31.39 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 468 aa  133  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  29.43 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  32.24 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  29.95 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  28.89 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.24 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  27.56 
 
 		 489 aa  124  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 		 689 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  30.48 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  31.35 
 
 		 371 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  30.56 
 
 		 652 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  32.83 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  32.83 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  26.93 
 
 		 360 aa  123  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 		 379 aa  122  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  29.16 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  29.44 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  30.16 
 
 		 319 aa  121  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  25.48 
 
 		 686 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 		 374 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  31.31 
 
 		 443 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  25.48 
 
 		 698 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  40.8 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  27.87 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.2 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  41.57 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  30.08 
 
 		 434 aa  117  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  29.97 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  31.3 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  31.8 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.04 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 		 325 aa  111  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  29.21 
 
 		 342 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.56 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.35 
 
 		 431 aa  109  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  26.13 
 
 		 420 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  27.01 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  27.41 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  27.72 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  26.54 
 
 		 450 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 		 657 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  29.61 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  28.7 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 		 318 aa  105  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  26.41 
 
 		 415 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  27.55 
 
 		 438 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  24.83 
 
 		 446 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  28.79 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  28.48 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  28.87 
 
 		 371 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.78 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  35.76 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.42 
 
 		 350 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  26.56 
 
 		 349 aa  100  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  27.45 
 
 		 355 aa  100  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 		 370 aa  99.4  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  28.35 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  29.49 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.53 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  27.88 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  28.94 
 
 		 431 aa  97.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  29.16 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  30.93 
 
 		 358 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.67 
 
 		 328 aa  97.1  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  34.27 
 
 		 335 aa  96.3  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  27.68 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>