278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0429 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
462 aa  937    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  38.05 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  28.24 
 
 
406 aa  124  5e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  29.09 
 
 
395 aa  124  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  29.24 
 
 
424 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  28.11 
 
 
438 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  35.92 
 
 
308 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  35.61 
 
 
313 aa  117  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  30.86 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  24.63 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  25.05 
 
 
434 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  34.6 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  24.63 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  34.8 
 
 
310 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  31.84 
 
 
368 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  25.34 
 
 
415 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  26.51 
 
 
450 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
334 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  33.65 
 
 
379 aa  109  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  24.84 
 
 
686 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  27.68 
 
 
415 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  24.42 
 
 
698 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  34.09 
 
 
488 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  26.18 
 
 
385 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 
689 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.02 
 
 
431 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  26.6 
 
 
671 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  24.46 
 
 
421 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  34.43 
 
 
370 aa  96.7  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  31.71 
 
 
328 aa  95.1  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  24.71 
 
 
446 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  30.95 
 
 
389 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  36.71 
 
 
440 aa  94.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  36.71 
 
 
440 aa  94.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0281  modification methylase (cytosine-specific methyltransferase  26.25 
 
 
520 aa  94  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.86 
 
 
362 aa  94  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  30.91 
 
 
409 aa  91.7  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  30.28 
 
 
313 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  45 
 
 
371 aa  90.5  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  30.04 
 
 
489 aa  90.9  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  33.02 
 
 
283 aa  90.1  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  29.65 
 
 
388 aa  90.1  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.84 
 
 
357 aa  89.7  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.01 
 
 
405 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  46.03 
 
 
350 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  32.27 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  24.68 
 
 
468 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  32.05 
 
 
437 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  30.97 
 
 
402 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1749  DNA-cytosine methyltransferase  50 
 
 
350 aa  87.4  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000535565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.46 
 
 
345 aa  87  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.02 
 
 
387 aa  87  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  24.42 
 
 
393 aa  87  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 
416 aa  86.7  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.92 
 
 
335 aa  86.7  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  31.1 
 
 
423 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  23.59 
 
 
500 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  33.48 
 
 
317 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  31.1 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  34.09 
 
 
508 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.26 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.36 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  31.51 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  31.94 
 
 
438 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.26 
 
 
501 aa  83.2  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  32.06 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  23.67 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  30.2 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  33.01 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.54 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  24.37 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.86 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  33.49 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  32.74 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.99 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  29.3 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  30.81 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  24.03 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  30.69 
 
 
437 aa  79  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  29.61 
 
 
319 aa  79  0.0000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.45 
 
 
395 aa  79  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  30.97 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
465 aa  79  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  27.85 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  26.51 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  25.08 
 
 
468 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  30.04 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 
452 aa  77.4  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  27.32 
 
 
320 aa  77  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  25.75 
 
 
361 aa  77  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  22.36 
 
 
460 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  29.86 
 
 
400 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  22.36 
 
 
460 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  31.43 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  27.16 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2061  DNA-cytosine methyltransferase  36.62 
 
 
511 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  26.96 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.11 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  29.13 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>