More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0756 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  56.26 
 
 
652 aa  739    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
671 aa  1353    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  38.41 
 
 
689 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  37.63 
 
 
686 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  37.42 
 
 
698 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  30.88 
 
 
500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  33.26 
 
 
452 aa  191  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  34 
 
 
415 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.59 
 
 
357 aa  182  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  32.68 
 
 
421 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  35.77 
 
 
373 aa  174  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  30 
 
 
489 aa  172  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  30.22 
 
 
418 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  30.22 
 
 
418 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  32.6 
 
 
395 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  27.64 
 
 
468 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  31.71 
 
 
492 aa  167  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  32.83 
 
 
657 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  30.04 
 
 
508 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 
474 aa  162  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 
360 aa  161  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  29.37 
 
 
434 aa  158  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.88 
 
 
431 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  28.75 
 
 
388 aa  150  8e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.27 
 
 
501 aa  147  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  30.48 
 
 
420 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  33.69 
 
 
361 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.73 
 
 
375 aa  141  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  31.28 
 
 
389 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  28.89 
 
 
440 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  30.55 
 
 
423 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  28.89 
 
 
440 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 
464 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  31.96 
 
 
365 aa  139  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  31.58 
 
 
518 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  30.44 
 
 
424 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  30.11 
 
 
438 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  30.87 
 
 
431 aa  137  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  30.83 
 
 
342 aa  136  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  30.59 
 
 
406 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.61 
 
 
446 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  26.71 
 
 
450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  32.26 
 
 
399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.57 
 
 
405 aa  134  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
358 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  30.31 
 
 
440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  28.15 
 
 
340 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  30.55 
 
 
429 aa  130  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  30.11 
 
 
371 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.57 
 
 
415 aa  130  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  31.28 
 
 
381 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  25.76 
 
 
488 aa  126  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  28.2 
 
 
415 aa  127  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 
412 aa  125  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  31.47 
 
 
398 aa  125  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 
337 aa  124  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  30.62 
 
 
355 aa  124  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 
400 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1494  DNA-cytosine methyltransferase  31.1 
 
 
423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 
373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 
377 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  26.63 
 
 
406 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  27.88 
 
 
352 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 
319 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  26.59 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  29.65 
 
 
365 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  30.87 
 
 
374 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 
354 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  31.5 
 
 
362 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  29.02 
 
 
434 aa  117  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 
502 aa  117  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 
375 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  27.6 
 
 
443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  25.56 
 
 
308 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  25.8 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  30.26 
 
 
446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  31.15 
 
 
358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  25.27 
 
 
323 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  29.05 
 
 
385 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  32.44 
 
 
434 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
310 aa  114  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
379 aa  114  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.11 
 
 
350 aa  114  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  27.57 
 
 
348 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  26.06 
 
 
423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.08 
 
 
335 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.18 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  30.71 
 
 
361 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
366 aa  110  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  24.87 
 
 
465 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  27.53 
 
 
419 aa  110  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.93 
 
 
359 aa  109  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  27.11 
 
 
368 aa  109  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  25.41 
 
 
313 aa  107  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  27.82 
 
 
419 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  30.97 
 
 
359 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  34.62 
 
 
313 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  28.91 
 
 
358 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  27.94 
 
 
349 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>