More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1839 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 318 aa  645    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  78.37 
 
 		 319 aa  539  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  78.46 
 
 		 313 aa  493  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  78.08 
 
 		 320 aa  484  1e-135  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  58.31 
 
 		 309 aa  355  7.999999999999999e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  51.85 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  53.5 
 
 		 320 aa  309  5e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  52.94 
 
 		 313 aa  305  5.0000000000000004e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1008  DNA-cytosine methyltransferase  39.83 
 
 		 367 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  40.22 
 
 		 366 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  40.22 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  35.12 
 
 		 365 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  32.6 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  33.93 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  30.66 
 
 		 374 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  34.71 
 
 		 342 aa  152  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  33.43 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.33 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  29.55 
 
 		 340 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  31.27 
 
 		 364 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  31.14 
 
 		 423 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  26.96 
 
 		 489 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  31.76 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.58 
 
 		 423 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  31.51 
 
 		 415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  30.68 
 
 		 438 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  31.7 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  31.47 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.78 
 
 		 359 aa  143  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.27 
 
 		 357 aa  144  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  29.1 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  31.15 
 
 		 454 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  31.1 
 
 		 371 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  30.88 
 
 		 414 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  30.42 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 		 465 aa  136  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  30.83 
 
 		 375 aa  136  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  31.18 
 
 		 348 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  30.3 
 
 		 365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  30.28 
 
 		 361 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.36 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 		 377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  29.94 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  28.01 
 
 		 356 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  29.88 
 
 		 335 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  28.86 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  29.68 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  28.11 
 
 		 370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  29.24 
 
 		 349 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  29.36 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  30.15 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  28.46 
 
 		 421 aa  125  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  28.24 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  29.94 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  29.97 
 
 		 657 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  26.33 
 
 		 689 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  26.33 
 
 		 686 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.47 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  29.86 
 
 		 361 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.38 
 
 		 375 aa  122  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 		 371 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  29.8 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.56 
 
 		 418 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  25.77 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  28.93 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  27.34 
 
 		 424 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  25.36 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.65 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  29.56 
 
 		 418 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  30.12 
 
 		 632 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.26 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  31.29 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  29.15 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 		 399 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 		 342 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  27.17 
 
 		 671 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  26.9 
 
 		 698 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  25.36 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  28.45 
 
 		 358 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.37 
 
 		 405 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.04 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  30.32 
 
 		 412 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  29.69 
 
 		 358 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2924  DNA-cytosine methyltransferase  30.2 
 
 		 537 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 		 400 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 		 652 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  39.05 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  26.72 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  29.33 
 
 		 662 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  28.98 
 
 		 359 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 		 398 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  25.32 
 
 		 468 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  25.86 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  37.36 
 
 		 283 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>