288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1018 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 446 aa  919    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  49.33 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.89 
 
 		 357 aa  170  6e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  29.91 
 
 		 489 aa  155  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  31.76 
 
 		 388 aa  154  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  30.41 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.03 
 
 		 373 aa  150  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  28.64 
 
 		 395 aa  140  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  27.52 
 
 		 657 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  27.72 
 
 		 362 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 		 464 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  27.72 
 
 		 440 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  26.61 
 
 		 671 aa  136  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  30.14 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  27.98 
 
 		 420 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  30.13 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  27.38 
 
 		 415 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.13 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  27.69 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  26.88 
 
 		 452 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.48 
 
 		 431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  26.29 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  27.8 
 
 		 468 aa  122  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.33 
 
 		 360 aa  121  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  24.62 
 
 		 652 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  28.85 
 
 		 438 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  27.21 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  26.29 
 
 		 381 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  27.07 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  26.59 
 
 		 446 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  27.68 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.11 
 
 		 375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  25.25 
 
 		 502 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 		 488 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  28.29 
 
 		 434 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  29.71 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  26.59 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1494  DNA-cytosine methyltransferase  26.86 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  25.33 
 
 		 689 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  25.62 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0281  modification methylase (cytosine-specific methyltransferase  25.46 
 
 		 520 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  27.68 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  36.63 
 
 		 283 aa  106  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  27.09 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  33.61 
 
 		 308 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  28.05 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3077  DNA-cytosine methyltransferase  24.33 
 
 		 517 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.485404  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.47 
 
 		 405 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  24.84 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  24.95 
 
 		 370 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  30.89 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  24.46 
 
 		 518 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  26.73 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  24.83 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.43 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  25.7 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  23.96 
 
 		 686 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  25.51 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  25.51 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  23.96 
 
 		 698 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2061  DNA-cytosine methyltransferase  24.39 
 
 		 511 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  24.8 
 
 		 492 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.73 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  33.2 
 
 		 313 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  27.65 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  23.98 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  35.29 
 
 		 328 aa  97.8  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  29.8 
 
 		 334 aa  97.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 		 508 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  25.62 
 
 		 438 aa  96.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  25.98 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  23.86 
 
 		 349 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  24.55 
 
 		 352 aa  94  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  24.36 
 
 		 462 aa  93.6  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.09 
 
 		 451 aa  93.2  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  24.09 
 
 		 319 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  24.15 
 
 		 323 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  25.35 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  24.33 
 
 		 454 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  23.44 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 465 aa  90.5  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  32.08 
 
 		 319 aa  89.7  8e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  23.01 
 
 		 373 aa  89  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.68 
 
 		 362 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  23.53 
 
 		 342 aa  87.4  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  23.15 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4096  DNA-cytosine methyltransferase  23.93 
 
 		 535 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30.3 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  26.14 
 
 		 318 aa  86.3  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  31.71 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.77 
 
 		 501 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  30.97 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  26.21 
 
 		 632 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.98 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  24.12 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>