292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2652 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 435 aa  887    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  69.72 
 
 		 434 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  39.33 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1494  DNA-cytosine methyltransferase  45.82 
 
 		 423 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  42.42 
 
 		 518 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  36.09 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  33.25 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  30.31 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.92 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  32.38 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 		 434 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  31.91 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  28.98 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  28.15 
 
 		 418 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  28.15 
 
 		 418 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  30.66 
 
 		 431 aa  130  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  29.61 
 
 		 440 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.58 
 
 		 446 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  29.61 
 
 		 440 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  30.09 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  31.14 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  30.17 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  30.81 
 
 		 443 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  25.89 
 
 		 489 aa  125  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  27.74 
 
 		 390 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.9 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.34 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  26.81 
 
 		 452 aa  120  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30.84 
 
 		 671 aa  119  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  27.41 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  29.88 
 
 		 652 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 		 361 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  25.59 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  29.32 
 
 		 385 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  28.82 
 
 		 377 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.34 
 
 		 387 aa  116  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  28.18 
 
 		 388 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  28.54 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  27.54 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  26.92 
 
 		 686 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  27.06 
 
 		 698 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 468 aa  113  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.93 
 
 		 657 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  30.79 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  39.15 
 
 		 283 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 		 361 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  26.08 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  28.23 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.34 
 
 		 488 aa  107  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 		 689 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00245  site-specific DNA-methyltransferase  41.41 
 
 		 735 aa  106  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.191981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  30.18 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  26.18 
 
 		 415 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  27.43 
 
 		 371 aa  103  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  30.02 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  25.75 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0401  C-5 cytosine-specific DNA methylase  51.61 
 
 		 520 aa  101  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.428624  hitchhiker  0.000124126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  37.99 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.23 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.65 
 
 		 362 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 		 420 aa  99.8  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  35.5 
 
 		 370 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  28.78 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 		 360 aa  98.2  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  26 
 
 		 468 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  35.92 
 
 		 429 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 		 373 aa  94.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  26.46 
 
 		 342 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  34.62 
 
 		 423 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  25.62 
 
 		 375 aa  93.2  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  33.7 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  26.23 
 
 		 334 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  37.17 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  23.17 
 
 		 474 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00287  probable C-5 cytosine-specific DNA methylase  50.54 
 
 		 113 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  26.7 
 
 		 335 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 		 323 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  28.75 
 
 		 365 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  26.05 
 
 		 356 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  27.98 
 
 		 399 aa  90.1  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  27.16 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  26.32 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  31.63 
 
 		 508 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.97 
 
 		 328 aa  88.6  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.72 
 
 		 405 aa  87  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  26.72 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  33.89 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  34.34 
 
 		 500 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  32.97 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.96 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  24.36 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  30.58 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  27.01 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.31 
 
 		 501 aa  84  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  30.2 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  30.6 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  27.42 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>