281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1414 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
419 aa  857    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  56.78 
 
 
399 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  55.42 
 
 
437 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  43.72 
 
 
402 aa  299  7e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  45.5 
 
 
393 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  45.32 
 
 
395 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  42.22 
 
 
409 aa  291  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  44.91 
 
 
399 aa  280  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  29.97 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  30.28 
 
 
318 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  27.79 
 
 
313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.25 
 
 
362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  29.82 
 
 
313 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 
308 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.63 
 
 
423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  28.27 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.63 
 
 
423 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.41 
 
 
357 aa  117  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  26.92 
 
 
465 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  28.08 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.3 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  23.91 
 
 
361 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
310 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  28.2 
 
 
671 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  29.12 
 
 
398 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  27.7 
 
 
468 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.64 
 
 
405 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  29.18 
 
 
412 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  26.56 
 
 
373 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  27.72 
 
 
632 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  27.85 
 
 
652 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 
662 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  27.81 
 
 
356 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  25.87 
 
 
328 aa  101  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  25.48 
 
 
388 aa  100  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  26.09 
 
 
415 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 
429 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  26.58 
 
 
406 aa  100  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  29.09 
 
 
399 aa  100  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  32.35 
 
 
334 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  27.71 
 
 
381 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  25.37 
 
 
418 aa  98.2  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  33.67 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  25.06 
 
 
450 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  26.09 
 
 
323 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  27.18 
 
 
362 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  24.39 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  23.17 
 
 
324 aa  95.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 
418 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 
657 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 
418 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  23.75 
 
 
338 aa  94.4  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  28.75 
 
 
400 aa  94  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  23.99 
 
 
337 aa  93.6  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  26.3 
 
 
313 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  25.42 
 
 
335 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  23.87 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  24.68 
 
 
452 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  25.31 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  23.33 
 
 
474 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  31.94 
 
 
440 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  30.04 
 
 
488 aa  91.3  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0281  modification methylase (cytosine-specific methyltransferase  24.68 
 
 
520 aa  90.9  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  29.36 
 
 
456 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  29.36 
 
 
456 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 
368 aa  89.7  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  27 
 
 
342 aa  89.7  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  25.32 
 
 
317 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  27.15 
 
 
329 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  23.9 
 
 
438 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.41 
 
 
431 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  27.06 
 
 
443 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  25.3 
 
 
335 aa  87.8  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  30.4 
 
 
435 aa  87.4  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  32.68 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  23.85 
 
 
327 aa  87.4  4e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  27.19 
 
 
489 aa  87.4  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  28.37 
 
 
464 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
689 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  28.63 
 
 
460 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  28.63 
 
 
460 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  24.83 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  28.9 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  25.46 
 
 
698 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  31.63 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  30.54 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  25.25 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  26.14 
 
 
371 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  22.79 
 
 
360 aa  84  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
440 aa  83.2  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
440 aa  83.2  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  25.91 
 
 
446 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  24.12 
 
 
686 aa  83.2  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  22.4 
 
 
329 aa  82.8  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  32.55 
 
 
283 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  28.86 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  28.28 
 
 
365 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  34.81 
 
 
319 aa  82  0.00000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>