282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0534 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
399 aa  816    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  57.51 
 
 
393 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  52.6 
 
 
402 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  52.14 
 
 
395 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  45.16 
 
 
409 aa  332  7.000000000000001e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  46.44 
 
 
399 aa  315  8e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  44.83 
 
 
437 aa  295  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  44.91 
 
 
419 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  30.39 
 
 
334 aa  150  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  29.68 
 
 
313 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  29.18 
 
 
313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.95 
 
 
362 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.43 
 
 
405 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 
370 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.71 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  30.85 
 
 
412 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  31.07 
 
 
318 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30.49 
 
 
423 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  31.5 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  27.35 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 
308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  30.39 
 
 
632 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  26.58 
 
 
361 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  27.92 
 
 
335 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  29.68 
 
 
398 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.85 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  26.2 
 
 
468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 
406 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  27.47 
 
 
421 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  26.72 
 
 
434 aa  117  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  29.97 
 
 
381 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
335 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.62 
 
 
431 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  26.03 
 
 
418 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.03 
 
 
418 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  23.97 
 
 
388 aa  112  9e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  28.2 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.89 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  29.74 
 
 
313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  25.78 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.16 
 
 
465 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  27.41 
 
 
415 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  23.06 
 
 
324 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
418 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  22.16 
 
 
327 aa  108  2e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  34.91 
 
 
662 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  29.25 
 
 
443 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.39 
 
 
415 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  26.03 
 
 
417 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  22.57 
 
 
450 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  27.01 
 
 
342 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  26.12 
 
 
431 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  23.48 
 
 
338 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  26.87 
 
 
365 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  24.42 
 
 
329 aa  103  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  26.78 
 
 
395 aa  102  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 
356 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  28.65 
 
 
345 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 
434 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 
361 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  27.6 
 
 
362 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  28.35 
 
 
429 aa  99.8  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  24.8 
 
 
417 aa  99.4  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  24.47 
 
 
323 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  25.31 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  26.65 
 
 
671 aa  97.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  26.68 
 
 
419 aa  97.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  26.58 
 
 
317 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.05 
 
 
375 aa  96.7  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 
368 aa  96.7  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.3 
 
 
395 aa  96.3  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  26 
 
 
454 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
438 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  24.02 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.65 
 
 
328 aa  95.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30.66 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  25.5 
 
 
348 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  26.48 
 
 
342 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  31.9 
 
 
452 aa  94  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  29.86 
 
 
657 aa  93.2  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  32.24 
 
 
440 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  23.16 
 
 
416 aa  93.2  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 
373 aa  93.2  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  24.48 
 
 
727 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  28.89 
 
 
319 aa  91.7  2e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 
488 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  23.26 
 
 
360 aa  92  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  31.16 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  23.64 
 
 
416 aa  90.9  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  24.54 
 
 
329 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 
400 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.32 
 
 
350 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 
446 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  23.09 
 
 
464 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  24.87 
 
 
320 aa  89.7  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  26.42 
 
 
319 aa  89.7  8e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  24.55 
 
 
350 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>