More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3855 on replicon NC_008608
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
313 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  73.51 
 
 
345 aa  474  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  44.95 
 
 
368 aa  260  3e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  37.81 
 
 
323 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  39.5 
 
 
379 aa  202  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  38.56 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  35.85 
 
 
313 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  40.06 
 
 
308 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  35.01 
 
 
328 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  35.56 
 
 
310 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  35.13 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  34.55 
 
 
335 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  35.11 
 
 
334 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.45 
 
 
395 aa  161  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  34.29 
 
 
370 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  40.19 
 
 
406 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  33.04 
 
 
335 aa  150  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  32.67 
 
 
386 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  35.26 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  32.7 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  33.69 
 
 
399 aa  142  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 
434 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.82 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
412 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  30.41 
 
 
350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.34 
 
 
431 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.94 
 
 
350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.15 
 
 
423 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.91 
 
 
405 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  27.48 
 
 
489 aa  125  7e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  31.56 
 
 
468 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  28.86 
 
 
423 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  29.17 
 
 
371 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  31.16 
 
 
400 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  28.67 
 
 
320 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  27.08 
 
 
438 aa  122  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  28.35 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  35.98 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  30.08 
 
 
398 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 
329 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  33.33 
 
 
312 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1749  DNA-cytosine methyltransferase  29.5 
 
 
350 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000535565  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  31.59 
 
 
632 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 
359 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  29.11 
 
 
320 aa  116  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
361 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.86 
 
 
387 aa  115  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  27.55 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  31.56 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  31.3 
 
 
460 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  31.3 
 
 
460 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  30.47 
 
 
429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  27.94 
 
 
406 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  27.96 
 
 
388 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  31.31 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  26.54 
 
 
329 aa  110  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  32.27 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  28.85 
 
 
338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  26.52 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  28.95 
 
 
662 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
395 aa  108  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
331 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  38.39 
 
 
283 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
727 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.07 
 
 
362 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  31.21 
 
 
438 aa  107  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  29.58 
 
 
381 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.88 
 
 
357 aa  105  7e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.62 
 
 
362 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  29.53 
 
 
342 aa  105  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 
370 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 
409 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 
416 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  27.22 
 
 
657 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  29.94 
 
 
399 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  26.89 
 
 
417 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  28.49 
 
 
325 aa  102  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  28.95 
 
 
305 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 
354 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  29.52 
 
 
364 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
418 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
418 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  30.91 
 
 
418 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
356 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  29.9 
 
 
615 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  26.18 
 
 
336 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  25.63 
 
 
327 aa  100  4e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  28.78 
 
 
348 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 
311 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 
414 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  28.99 
 
 
417 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 
413 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
360 aa  98.2  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  25.88 
 
 
465 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 
456 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  33.64 
 
 
508 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 
456 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 
402 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  35.33 
 
 
434 aa  97.4  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.19 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>