More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0652 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
329 aa  678    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  52.58 
 
 
350 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  51.98 
 
 
350 aa  343  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  54.22 
 
 
311 aa  333  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  53.8 
 
 
318 aa  308  5.9999999999999995e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  52.88 
 
 
319 aa  305  6e-82  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  42.58 
 
 
328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  40.58 
 
 
305 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  38.05 
 
 
329 aa  185  9e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  33.63 
 
 
338 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  35.89 
 
 
416 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  38.3 
 
 
324 aa  179  7e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  33.43 
 
 
417 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  33.62 
 
 
419 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  36.92 
 
 
327 aa  171  1e-41  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  36.11 
 
 
417 aa  169  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  31.56 
 
 
727 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  36.01 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  32.21 
 
 
331 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  33.83 
 
 
424 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  31.92 
 
 
436 aa  155  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  33.02 
 
 
320 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  30.51 
 
 
426 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  32.44 
 
 
416 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  34.66 
 
 
415 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.42 
 
 
328 aa  151  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  31.01 
 
 
352 aa  150  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  32.93 
 
 
336 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.24 
 
 
418 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  31.36 
 
 
428 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  30.03 
 
 
323 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  32.33 
 
 
406 aa  146  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.87 
 
 
334 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  30.84 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  30.96 
 
 
487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  32.28 
 
 
373 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  31.42 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  31.44 
 
 
491 aa  135  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  29.93 
 
 
313 aa  135  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  30.2 
 
 
474 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  33.14 
 
 
447 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  29.91 
 
 
657 aa  133  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  28.74 
 
 
368 aa  133  5e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.18 
 
 
335 aa  130  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  28.27 
 
 
423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  28.88 
 
 
423 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.22 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  30.24 
 
 
417 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  30.16 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  31.93 
 
 
323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  29.49 
 
 
476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  29.97 
 
 
476 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  29.97 
 
 
476 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  29.97 
 
 
476 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  29.97 
 
 
476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  30.2 
 
 
308 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.63 
 
 
451 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  37.74 
 
 
406 aa  125  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  36.7 
 
 
437 aa  122  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  30.25 
 
 
472 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  30.25 
 
 
472 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  29.33 
 
 
472 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  30.25 
 
 
472 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  30.25 
 
 
472 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  29.81 
 
 
472 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  29.81 
 
 
472 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  30.03 
 
 
471 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  28.88 
 
 
313 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.58 
 
 
405 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  27.17 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  37.82 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  29.62 
 
 
337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.09 
 
 
357 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  27.16 
 
 
427 aa  116  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  26.81 
 
 
318 aa  116  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  36.07 
 
 
438 aa  116  6e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  26.28 
 
 
359 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  31.55 
 
 
468 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  32.31 
 
 
460 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  32.31 
 
 
460 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1422  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
365 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0062681  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  26.49 
 
 
415 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  29.34 
 
 
444 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  28.57 
 
 
495 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  29.84 
 
 
342 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  27.61 
 
 
361 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 
350 aa  106  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 
467 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.61 
 
 
362 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 
412 aa  105  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
456 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  25.62 
 
 
345 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  26.44 
 
 
348 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  24.7 
 
 
490 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  26.98 
 
 
407 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
456 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  24.2 
 
 
418 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  24.2 
 
 
418 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.72 
 
 
362 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>