293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0819 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  100 
 
 		 388 aa  799    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  35.24 
 
 		 420 aa  222  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  36.64 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  32.1 
 
 		 657 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  37.23 
 
 		 489 aa  204  3e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.94 
 
 		 357 aa  199  7.999999999999999e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  29.62 
 
 		 452 aa  180  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3077  DNA-cytosine methyltransferase  29.35 
 
 		 517 aa  176  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.485404  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  27.13 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2061  DNA-cytosine methyltransferase  27.22 
 
 		 511 aa  173  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0281  modification methylase (cytosine-specific methyltransferase  29.22 
 
 		 520 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4096  DNA-cytosine methyltransferase  29.16 
 
 		 535 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  30.63 
 
 		 373 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  29.38 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  31.22 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  31.34 
 
 		 434 aa  160  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  29.77 
 
 		 361 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  29.4 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4264  DNA-cytosine methyltransferase  27.38 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  31.76 
 
 		 446 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 		 488 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  28.75 
 
 		 671 aa  156  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.09 
 
 		 431 aa  155  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  31.33 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  31.7 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  30.29 
 
 		 450 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  31.7 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  30.33 
 
 		 698 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  30.92 
 
 		 421 aa  153  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  29.76 
 
 		 686 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  32.42 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 		 689 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  28.64 
 
 		 468 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  31.68 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  26.7 
 
 		 652 aa  143  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  25.83 
 
 		 365 aa  143  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 		 468 aa  142  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  29.93 
 
 		 377 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.64 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  29.84 
 
 		 398 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 		 390 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  28.23 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  30.61 
 
 		 381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.63 
 
 		 313 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.66 
 
 		 387 aa  133  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  29.05 
 
 		 349 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  25.68 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  27.01 
 
 		 443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.35 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  28.89 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30.41 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.41 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  26.12 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.68 
 
 		 370 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  25.25 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  25.95 
 
 		 440 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  25.95 
 
 		 440 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  29.38 
 
 		 334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  29.16 
 
 		 464 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  30.1 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  25 
 
 		 492 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  25.97 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.11 
 
 		 328 aa  125  9e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  31.35 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.5 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.01 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  29.5 
 
 		 337 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 		 348 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  26.22 
 
 		 342 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  31.17 
 
 		 368 aa  123  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  26.93 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  26.4 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  27.55 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  29.8 
 
 		 438 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  25.61 
 
 		 438 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.79 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 		 508 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 		 361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30.5 
 
 		 379 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  27.15 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  25.58 
 
 		 632 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  29.11 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  26.29 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  30.83 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  27.81 
 
 		 361 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  27.55 
 
 		 356 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  28.05 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.87 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1494  DNA-cytosine methyltransferase  27.15 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.15 
 
 		 501 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  27.15 
 
 		 518 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  26.12 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  26.2 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 		 313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1008  DNA-cytosine methyltransferase  25.41 
 
 		 367 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  25.62 
 
 		 454 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>