More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0272 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
308 aa  641    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  65.05 
 
 
313 aa  442  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  58.47 
 
 
313 aa  387  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  53.27 
 
 
310 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  41.08 
 
 
334 aa  232  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  54.82 
 
 
406 aa  223  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  37.43 
 
 
323 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  37.99 
 
 
368 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  37.13 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  39.49 
 
 
379 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  36.83 
 
 
345 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  40.06 
 
 
313 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  35.12 
 
 
335 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  33.8 
 
 
370 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  35.01 
 
 
335 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.02 
 
 
395 aa  169  6e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  32.38 
 
 
398 aa  165  9e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  34.68 
 
 
319 aa  160  2e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.72 
 
 
357 aa  159  8e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  33.62 
 
 
468 aa  158  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  30.72 
 
 
416 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  32.11 
 
 
417 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  32.59 
 
 
362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  33.88 
 
 
342 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.51 
 
 
328 aa  151  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  33.13 
 
 
364 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  29.21 
 
 
489 aa  149  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  32.26 
 
 
337 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  34.12 
 
 
348 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  31.55 
 
 
370 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  30.97 
 
 
329 aa  149  7e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  31.61 
 
 
350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  30.38 
 
 
418 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  30.38 
 
 
418 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  31.29 
 
 
350 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  34.81 
 
 
312 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.78 
 
 
373 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  31.7 
 
 
386 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.87 
 
 
423 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  29.11 
 
 
320 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  32.26 
 
 
412 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  29.33 
 
 
371 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  30.79 
 
 
390 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  31.88 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.69 
 
 
405 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.29 
 
 
431 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  30.54 
 
 
421 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  32.43 
 
 
309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.65 
 
 
423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  30.24 
 
 
434 aa  139  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  39.08 
 
 
413 aa  138  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  31.34 
 
 
415 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  30.34 
 
 
416 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  30.23 
 
 
338 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  31.48 
 
 
399 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  29.69 
 
 
414 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  31.79 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  31.58 
 
 
398 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  32.61 
 
 
317 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  31.07 
 
 
305 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  29.15 
 
 
419 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  28.85 
 
 
361 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  29.4 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  27.67 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  32.74 
 
 
400 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  28.37 
 
 
454 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  28.67 
 
 
327 aa  132  5e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
409 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 
465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  26.77 
 
 
727 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  30.12 
 
 
359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  29.19 
 
 
324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
399 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.29 
 
 
362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  32.2 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  30.68 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  30.36 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  32.12 
 
 
615 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  29.75 
 
 
356 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  30.4 
 
 
323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  32.46 
 
 
381 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  30.75 
 
 
429 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  30.08 
 
 
431 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  30.98 
 
 
417 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  29.14 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  29.97 
 
 
438 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  29.05 
 
 
417 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.72 
 
 
387 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  31.14 
 
 
406 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  29.39 
 
 
415 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  30.17 
 
 
434 aa  126  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.61 
 
 
360 aa  124  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  30.2 
 
 
329 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  28.71 
 
 
318 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  29.36 
 
 
350 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  28.66 
 
 
406 aa  123  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  25.39 
 
 
336 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>