270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2442 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 464 aa  956    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1494  DNA-cytosine methyltransferase  45.61 
 
 		 423 aa  326  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  43.43 
 
 		 518 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  39.33 
 
 		 435 aa  282  9e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  37.97 
 
 		 440 aa  273  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  38.04 
 
 		 434 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  29.13 
 
 		 415 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  28.97 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 		 434 aa  141  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  29.5 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.3 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  29.3 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 		 671 aa  139  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  25.81 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  28.9 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.91 
 
 		 415 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.05 
 
 		 431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  25.29 
 
 		 446 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  29.16 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  28.44 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  27.95 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  26.45 
 
 		 652 aa  126  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  27.53 
 
 		 686 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  27.53 
 
 		 698 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  27.74 
 
 		 489 aa  123  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.23 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  27.04 
 
 		 373 aa  121  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  26.29 
 
 		 361 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  26.6 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  28.1 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  25.78 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  27.13 
 
 		 689 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  27.5 
 
 		 423 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  25.65 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.61 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.76 
 
 		 357 aa  111  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  26.02 
 
 		 492 aa  110  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  26.48 
 
 		 361 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  26.78 
 
 		 358 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  25.17 
 
 		 657 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  26.35 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  27.08 
 
 		 398 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 		 365 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  25.11 
 
 		 402 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  26.54 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.47 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  27.67 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  26.51 
 
 		 337 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  26.35 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  25.23 
 
 		 474 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  24.77 
 
 		 362 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  26.43 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  28.79 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  28.12 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0401  C-5 cytosine-specific DNA methylase  54.44 
 
 		 520 aa  100  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.428624  hitchhiker  0.000124126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.18 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  24.1 
 
 		 365 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  32.04 
 
 		 283 aa  100  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  25.24 
 
 		 342 aa  100  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  25.8 
 
 		 632 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00245  site-specific DNA-methyltransferase  39.1 
 
 		 735 aa  99.8  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.191981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  27.51 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.27 
 
 		 387 aa  96.3  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  26.9 
 
 		 465 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  25.28 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  31.75 
 
 		 356 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  24.31 
 
 		 313 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00287  probable C-5 cytosine-specific DNA methylase  55.56 
 
 		 113 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.18 
 
 		 328 aa  95.5  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  25.47 
 
 		 438 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  26.8 
 
 		 508 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  25.99 
 
 		 355 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  25.06 
 
 		 395 aa  93.6  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  22.12 
 
 		 393 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  25.94 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  24.84 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.01 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.59 
 
 		 501 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  24.4 
 
 		 437 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  32.18 
 
 		 334 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.69 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  26.86 
 
 		 313 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  24.18 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  32.5 
 
 		 370 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  28.37 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  33.67 
 
 		 385 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  25.68 
 
 		 468 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  26.28 
 
 		 368 aa  86.3  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  32.27 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  23.33 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 		 662 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  24.45 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  23.81 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>