289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7069 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
393 aa  809    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  59.39 
 
 
395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  53.11 
 
 
402 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  57.51 
 
 
399 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  47.45 
 
 
409 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  47.06 
 
 
399 aa  318  7e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  45.45 
 
 
419 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  43.66 
 
 
437 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.75 
 
 
423 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30.95 
 
 
423 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  30.18 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  29.22 
 
 
361 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  26.96 
 
 
313 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 
370 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.78 
 
 
362 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  26.63 
 
 
313 aa  136  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.34 
 
 
328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  27.11 
 
 
632 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.08 
 
 
405 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  28.35 
 
 
359 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  30.07 
 
 
412 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  27.66 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  26.36 
 
 
337 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  26.77 
 
 
334 aa  126  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 
385 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  25.91 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 
465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.1 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  26.74 
 
 
308 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  27.06 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.06 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  32.77 
 
 
662 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  25.59 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  27.42 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 
421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  26.61 
 
 
342 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 
335 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  26.85 
 
 
356 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  25.3 
 
 
388 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  25.2 
 
 
323 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  24.24 
 
 
324 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  26.85 
 
 
368 aa  107  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  27.74 
 
 
431 aa  107  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  24.81 
 
 
319 aa  106  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  29.02 
 
 
361 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  25.55 
 
 
335 aa  102  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  28.71 
 
 
418 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.43 
 
 
431 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  31.05 
 
 
443 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  25.58 
 
 
379 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  25.06 
 
 
338 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  26.65 
 
 
434 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  25.06 
 
 
416 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  26.72 
 
 
438 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  26.64 
 
 
364 aa  99.8  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
419 aa  99.4  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  27.74 
 
 
389 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  30.22 
 
 
434 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  27.21 
 
 
362 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  25.19 
 
 
329 aa  98.6  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  28.16 
 
 
450 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  25.85 
 
 
329 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  27.89 
 
 
428 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  27.69 
 
 
395 aa  96.7  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  26.72 
 
 
436 aa  96.3  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
400 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.82 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 
426 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  28.68 
 
 
381 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  25.69 
 
 
417 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  26.09 
 
 
348 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  28.31 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  30.97 
 
 
508 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  23.68 
 
 
331 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  22.12 
 
 
464 aa  93.6  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  23.38 
 
 
727 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  26.44 
 
 
429 aa  92.8  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  23.94 
 
 
474 aa  92.8  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.17 
 
 
415 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  26.7 
 
 
313 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  26.55 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  26.24 
 
 
454 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
317 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  23.04 
 
 
417 aa  90.1  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  24.7 
 
 
352 aa  89.7  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  25.86 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  25.64 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  25.37 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 
361 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
686 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  24.72 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  29.13 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  25.36 
 
 
415 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  25.83 
 
 
399 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  25.45 
 
 
698 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  28.83 
 
 
424 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  30.88 
 
 
283 aa  86.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>