More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4962 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
342 aa  706    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  64 
 
 
337 aa  441  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  33.88 
 
 
308 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  35.26 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  33.86 
 
 
313 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  32.06 
 
 
368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  33.75 
 
 
345 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.46 
 
 
357 aa  139  7.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
323 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.74 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  31.17 
 
 
334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  27.68 
 
 
395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  31.75 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  32.86 
 
 
379 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  30.19 
 
 
328 aa  125  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.95 
 
 
405 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30.09 
 
 
423 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  27.71 
 
 
402 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  29.78 
 
 
415 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  30.21 
 
 
421 aa  119  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
423 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.7 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  29.23 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  28.78 
 
 
359 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  30.34 
 
 
468 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.51 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  26.61 
 
 
393 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  33.12 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  29.21 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  30.03 
 
 
632 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  27.39 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  27.84 
 
 
418 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.84 
 
 
418 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  31.25 
 
 
615 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  32.35 
 
 
429 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  29.22 
 
 
310 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  30.99 
 
 
406 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  29.78 
 
 
371 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  28.57 
 
 
364 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  30.19 
 
 
320 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  29.94 
 
 
412 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  29.62 
 
 
329 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  26.63 
 
 
360 aa  104  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  30.84 
 
 
324 aa  104  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  25.85 
 
 
388 aa  103  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  28.46 
 
 
662 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.98 
 
 
451 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  31.06 
 
 
434 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  26.44 
 
 
361 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  36.04 
 
 
434 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  26.79 
 
 
414 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 
325 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  28.19 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.17 
 
 
415 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
318 aa  99  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  37.89 
 
 
331 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  28.15 
 
 
323 aa  98.2  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  29.32 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  30.56 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  29.64 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  29.15 
 
 
313 aa  97.8  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
370 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  27.94 
 
 
311 aa  97.1  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  32.18 
 
 
406 aa  97.1  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 
342 aa  96.7  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  29.06 
 
 
390 aa  95.9  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.63 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  28.05 
 
 
309 aa  95.9  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 
426 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  25.19 
 
 
399 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  38.98 
 
 
437 aa  95.1  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3525  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.01 
 
 
571 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000124097  hitchhiker  0.00602561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  26.73 
 
 
417 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  27.82 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  29.89 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  26.69 
 
 
428 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.16 
 
 
312 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  36.65 
 
 
727 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
416 aa  94  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.88 
 
 
362 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  27.68 
 
 
356 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
329 aa  94  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.33 
 
 
418 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  28.28 
 
 
415 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  29.39 
 
 
319 aa  93.6  5e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
313 aa  92.8  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2924  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
537 aa  92.8  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 
671 aa  92.4  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
416 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 
465 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  32.81 
 
 
460 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  32.81 
 
 
460 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  27.49 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  25.97 
 
 
489 aa  90.5  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.64 
 
 
431 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 
399 aa  90.5  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3602  DNA-cytosine methyltransferase  56.96 
 
 
86 aa  90.5  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>