296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4863 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
418 aa  861    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  60.5 
 
 
318 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  54.75 
 
 
359 aa  350  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  40.56 
 
 
632 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  38.99 
 
 
662 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
423 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  31.6 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.71 
 
 
362 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  28.12 
 
 
361 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 
395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.49 
 
 
334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
409 aa  116  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  28.87 
 
 
337 aa  116  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 
370 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.61 
 
 
405 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  37.16 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  30.4 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  26.01 
 
 
727 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.27 
 
 
357 aa  108  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  26.41 
 
 
331 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  26.25 
 
 
308 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  24.81 
 
 
402 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.43 
 
 
328 aa  103  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  28.71 
 
 
393 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  30.91 
 
 
313 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
356 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  30.37 
 
 
429 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  33.53 
 
 
434 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  27.61 
 
 
313 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  29.34 
 
 
313 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  28.24 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  28.15 
 
 
652 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  26.33 
 
 
465 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  27.78 
 
 
657 aa  97.8  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  28.09 
 
 
416 aa  97.4  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  26.14 
 
 
319 aa  97.4  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  28.34 
 
 
305 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  24.33 
 
 
415 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  34.02 
 
 
440 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  26.2 
 
 
311 aa  95.9  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  26.33 
 
 
419 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  32.64 
 
 
329 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 
671 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
399 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  25.94 
 
 
438 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  29.72 
 
 
379 aa  93.6  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  28.82 
 
 
345 aa  92.8  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
412 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  25.29 
 
 
416 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 
437 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  25.77 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  31.91 
 
 
406 aa  90.5  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  28.24 
 
 
489 aa  90.1  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
460 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
460 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
418 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
418 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.46 
 
 
362 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  33.33 
 
 
395 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 
456 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  24 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.32 
 
 
431 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  25.8 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 
456 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  28.78 
 
 
406 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  26.8 
 
 
342 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  26.1 
 
 
310 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  28.62 
 
 
342 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  26.44 
 
 
318 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
421 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  25.74 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 
375 aa  87.4  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.97 
 
 
236 aa  87.8  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  36.16 
 
 
424 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  26.97 
 
 
329 aa  87  6e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  34.29 
 
 
374 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  27.02 
 
 
335 aa  86.7  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  30.51 
 
 
437 aa  86.3  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  28.12 
 
 
365 aa  86.3  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  26.63 
 
 
468 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  25.65 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.65 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28 
 
 
451 aa  84.7  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  26.46 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  26.99 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 
698 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 
686 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  27.84 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  26.91 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  24.27 
 
 
368 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 
689 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  26.65 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  24.79 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  26.14 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  26.05 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  29.89 
 
 
438 aa  82  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
467 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  23.46 
 
 
427 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  29.35 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>