299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001833 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 427 aa  890    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  43.4 
 
 		 490 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  48.5 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.25 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  26.96 
 
 		 727 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  29.39 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  30.42 
 
 		 305 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  28.88 
 
 		 311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  27.74 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  43.35 
 
 		 483 aa  131  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  27.89 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  26.61 
 
 		 324 aa  126  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  30.72 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 		 426 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 		 417 aa  123  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  27.6 
 
 		 350 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  27 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  30.43 
 
 		 417 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  27.51 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  30.97 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  29.25 
 
 		 657 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  30.52 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.66 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  26.07 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  29.14 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  28.23 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  27.16 
 
 		 329 aa  116  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  25.23 
 
 		 338 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  31.42 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  31.42 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  28.19 
 
 		 423 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  29.02 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  37.87 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.79 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  38.42 
 
 		 435 aa  111  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  29.71 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  26.75 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.18 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  40.8 
 
 		 239 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24513  predicted protein  27.52 
 
 		 820 aa  107  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.558259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  27.56 
 
 		 319 aa  106  7e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  34.71 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  25.3 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.66 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.05 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  31.2 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  29.08 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.47 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  33.72 
 
 		 438 aa  103  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  29.22 
 
 		 345 aa  103  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  31.58 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  25.88 
 
 		 313 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1422  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0062681  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  28.66 
 
 		 425 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.14 
 
 		 236 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2841  DNA-cytosine methyltransferase  31.47 
 
 		 719 aa  99.8  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0393  DNA-cytosine methyltransferase  31.47 
 
 		 719 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  25.16 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  35.44 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  29.85 
 
 		 379 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1499  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 		 703 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4109  DNA-cytosine methyltransferase  37.5 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  25.79 
 
 		 313 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  27.25 
 
 		 373 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  26.48 
 
 		 424 aa  96.3  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1364  DNA methyltransferase  29.71 
 
 		 535 aa  94.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513353  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  36.31 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2261  DNA-cytosine methyltransferase  35.43 
 
 		 387 aa  94  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  29.51 
 
 		 487 aa  93.2  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 		 313 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  26.49 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  28.17 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  27.33 
 
 		 318 aa  92  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  25.37 
 
 		 335 aa  91.3  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  25.98 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 		 383 aa  90.9  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  31 
 
 		 465 aa  90.5  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1337  DNA-cytosine methyltransferase  34.97 
 
 		 393 aa  90.5  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.911958 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.34 
 
 		 424 aa  90.5  6e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  28.08 
 
 		 495 aa  90.1  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_25785  predicted protein  25.42 
 
 		 778 aa  89.7  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00893206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  26.47 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1389  DNA-cytosine methyltransferase  33.52 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  34.16 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  32.84 
 
 		 423 aa  89  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  24.4 
 
 		 335 aa  89  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  32.16 
 
 		 460 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  32.04 
 
 		 456 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  27.25 
 
 		 348 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  32.04 
 
 		 456 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  32.16 
 
 		 460 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0547  DNA-cytosine methyltransferase  37.29 
 
 		 383 aa  86.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1810  C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.13 
 
 		 382 aa  86.3  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  33.89 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  31.61 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30.69 
 
 		 671 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>