More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_00371 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  100 
 
 
305 aa  624  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  61.44 
 
 
328 aa  382  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  54.15 
 
 
416 aa  348  7e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  53.87 
 
 
417 aa  335  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  51.57 
 
 
323 aa  291  7e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  50 
 
 
417 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  49.85 
 
 
425 aa  282  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  49.08 
 
 
406 aa  278  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  47.77 
 
 
419 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  49.68 
 
 
320 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  49.71 
 
 
424 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  47.38 
 
 
487 aa  269  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  46.85 
 
 
426 aa  268  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  45.72 
 
 
428 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  46.81 
 
 
415 aa  267  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  47.24 
 
 
417 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  44.22 
 
 
436 aa  261  6.999999999999999e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  44.64 
 
 
418 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  44.44 
 
 
416 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  43.67 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  41.62 
 
 
474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  42.31 
 
 
491 aa  242  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  41.69 
 
 
324 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  42.74 
 
 
447 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  41.64 
 
 
471 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  41.46 
 
 
329 aa  235  6e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  41.67 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  41.14 
 
 
417 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  42.94 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  41.19 
 
 
472 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  40.62 
 
 
472 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  41.19 
 
 
472 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  40.62 
 
 
472 aa  231  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  40.62 
 
 
472 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  40.62 
 
 
472 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  40.62 
 
 
472 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  42.32 
 
 
327 aa  230  2e-59  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  40.23 
 
 
476 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  40.23 
 
 
476 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  40.23 
 
 
476 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  40.23 
 
 
476 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  40.23 
 
 
476 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  42.21 
 
 
336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  40.26 
 
 
320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  38.84 
 
 
727 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  39.73 
 
 
373 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  38.84 
 
 
331 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  37.43 
 
 
350 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  40.88 
 
 
319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  36.53 
 
 
350 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  40.58 
 
 
329 aa  198  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  38.68 
 
 
657 aa  198  7.999999999999999e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  52.3 
 
 
438 aa  177  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  50.6 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  48.81 
 
 
437 aa  166  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  32.85 
 
 
352 aa  163  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  44.5 
 
 
460 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  35.01 
 
 
350 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  44.5 
 
 
460 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  38.53 
 
 
467 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  44.22 
 
 
456 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  44.22 
 
 
456 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  30.03 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  33.65 
 
 
495 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.33 
 
 
313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.12 
 
 
328 aa  144  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  30.18 
 
 
315 aa  142  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  34.47 
 
 
368 aa  142  9e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  45.45 
 
 
413 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 
310 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  29.67 
 
 
444 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  30.42 
 
 
427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  31.07 
 
 
308 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.65 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  31.9 
 
 
423 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  31.6 
 
 
423 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
383 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  43.56 
 
 
483 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  38.2 
 
 
406 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  29.77 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  37.57 
 
 
335 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  28.9 
 
 
348 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.46 
 
 
435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.03 
 
 
357 aa  118  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 
490 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  29.09 
 
 
323 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.45 
 
 
370 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  28.62 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 
379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 
361 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  29.38 
 
 
321 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  40 
 
 
239 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  28.17 
 
 
356 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  29.83 
 
 
372 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 
361 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  29.44 
 
 
465 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.17 
 
 
424 aa  105  8e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  27.76 
 
 
390 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  28.01 
 
 
385 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  35.43 
 
 
407 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>