294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1270 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
406 aa  834    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  59.51 
 
 
429 aa  485  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  55 
 
 
405 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  51.75 
 
 
412 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  33.51 
 
 
465 aa  154  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  32.1 
 
 
362 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  31.72 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.47 
 
 
373 aa  141  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 
361 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  32.13 
 
 
385 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  30.59 
 
 
671 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 
468 aa  136  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  31.44 
 
 
438 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  29.9 
 
 
652 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  29.29 
 
 
421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.21 
 
 
313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.08 
 
 
357 aa  127  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  30.09 
 
 
323 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  31.14 
 
 
308 aa  126  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.28 
 
 
431 aa  125  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  30.08 
 
 
371 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  27.55 
 
 
434 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  29.23 
 
 
362 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  30.37 
 
 
395 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  28.13 
 
 
418 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  28.13 
 
 
418 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  29.06 
 
 
320 aa  122  8e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.46 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  26.36 
 
 
443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 
400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  26.3 
 
 
415 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  26.64 
 
 
452 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  30.31 
 
 
657 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  27.58 
 
 
388 aa  117  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  30.39 
 
 
328 aa  117  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  31.69 
 
 
335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  32.66 
 
 
348 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.18 
 
 
335 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  29.6 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.14 
 
 
313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  26.75 
 
 
431 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.98 
 
 
310 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  27.94 
 
 
313 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  30.2 
 
 
345 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  26.12 
 
 
360 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  30.46 
 
 
340 aa  112  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  27.17 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  28.6 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  25.94 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  30.4 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.96 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  28.08 
 
 
375 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  26.27 
 
 
356 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  27.53 
 
 
632 aa  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 
319 aa  109  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  29.06 
 
 
402 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  30.56 
 
 
352 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.28 
 
 
334 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
454 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  30.99 
 
 
342 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  27.25 
 
 
450 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  28.37 
 
 
325 aa  106  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.65 
 
 
415 aa  106  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 
424 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  28.74 
 
 
440 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 
399 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  28.09 
 
 
395 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  28.32 
 
 
359 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  28.61 
 
 
381 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  34.92 
 
 
283 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 
415 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  27.55 
 
 
365 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  26.84 
 
 
313 aa  101  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  26.58 
 
 
419 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  29.18 
 
 
318 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  27.18 
 
 
409 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 
354 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.07 
 
 
359 aa  100  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 
337 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 
361 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  27.51 
 
 
464 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  26.51 
 
 
318 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  26.6 
 
 
474 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  27.72 
 
 
370 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  28.68 
 
 
399 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  27.88 
 
 
361 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.65 
 
 
350 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  27.12 
 
 
414 aa  96.7  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  26.18 
 
 
416 aa  96.7  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  27.41 
 
 
320 aa  96.3  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 
393 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  26.65 
 
 
437 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.37 
 
 
362 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
417 aa  94  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  28.66 
 
 
319 aa  94  4e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  32.12 
 
 
406 aa  93.6  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  26.89 
 
 
358 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>