290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3572 on replicon NC_013412
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
370 aa  766    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  65.59 
 
 
371 aa  482  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  65.45 
 
 
350 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  62.71 
 
 
350 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1749  DNA-cytosine methyltransferase  65.24 
 
 
350 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000535565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  42.11 
 
 
323 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  41.76 
 
 
379 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  38.95 
 
 
386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.95 
 
 
313 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.92 
 
 
313 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  33.62 
 
 
345 aa  162  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  31.83 
 
 
308 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  34.29 
 
 
313 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  32.12 
 
 
368 aa  157  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  33.53 
 
 
334 aa  152  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 
310 aa  142  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.54 
 
 
357 aa  139  8.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.2 
 
 
328 aa  137  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  31.33 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  31.63 
 
 
423 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.94 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  28.14 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  28.27 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  30.75 
 
 
632 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  27.76 
 
 
412 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  35.57 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  27.6 
 
 
373 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.31 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  27.62 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  31.52 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
329 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  26.58 
 
 
395 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  28.69 
 
 
350 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  28.43 
 
 
395 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  27.63 
 
 
324 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  32.64 
 
 
398 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.81 
 
 
405 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  29.32 
 
 
350 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  29.26 
 
 
319 aa  108  2e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 
361 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  29.44 
 
 
400 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 
361 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  27.82 
 
 
424 aa  106  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  26.77 
 
 
409 aa  105  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  27.72 
 
 
406 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  28.49 
 
 
325 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.19 
 
 
395 aa  104  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 
446 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  25.19 
 
 
474 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  29.01 
 
 
454 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  25.64 
 
 
489 aa  103  7e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  27.47 
 
 
398 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  28.84 
 
 
399 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  26.3 
 
 
371 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  28.27 
 
 
450 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  27.53 
 
 
402 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  29.33 
 
 
309 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  26.37 
 
 
415 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  26.46 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  27.19 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  27.16 
 
 
320 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  30.83 
 
 
468 aa  97.8  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  30.45 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  24.75 
 
 
689 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  28.29 
 
 
354 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  27.19 
 
 
727 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  34.6 
 
 
462 aa  97.1  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  26.7 
 
 
415 aa  96.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  25.13 
 
 
360 aa  96.3  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
465 aa  96.3  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  27.44 
 
 
434 aa  95.9  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  29.46 
 
 
414 aa  95.9  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  28.7 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  26.54 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  26.97 
 
 
362 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  26.73 
 
 
657 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  23.76 
 
 
468 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  29.49 
 
 
388 aa  94.7  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.32 
 
 
319 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  26.1 
 
 
416 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  23.92 
 
 
338 aa  93.6  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.38 
 
 
418 aa  93.2  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  25.73 
 
 
320 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.41 
 
 
362 aa  92.8  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  28.39 
 
 
389 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.46 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  30.12 
 
 
337 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
671 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 
429 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.94 
 
 
387 aa  91.3  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  25.77 
 
 
416 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  29.8 
 
 
320 aa  91.3  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  31.97 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  25.12 
 
 
431 aa  90.5  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  27.51 
 
 
340 aa  89.7  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
662 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  26.84 
 
 
419 aa  89.4  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>