More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4525 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
337 aa  698    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  64 
 
 
342 aa  441  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.1 
 
 
357 aa  159  7e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.59 
 
 
313 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  32.26 
 
 
308 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  33.05 
 
 
423 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  32.2 
 
 
423 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  32.33 
 
 
368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  32.7 
 
 
313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  29.24 
 
 
402 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  32.26 
 
 
313 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.89 
 
 
345 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  34.1 
 
 
310 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 
409 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  29.35 
 
 
395 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  31.19 
 
 
415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  32.42 
 
 
334 aa  139  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.02 
 
 
328 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  31.1 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
359 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.47 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  26.36 
 
 
393 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 
671 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  30.09 
 
 
328 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  32.37 
 
 
323 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  29.77 
 
 
388 aa  122  8e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
652 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  30.53 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  32.06 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  29.55 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
379 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  30.4 
 
 
662 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  31.33 
 
 
632 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  30.37 
 
 
400 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  29.25 
 
 
342 aa  119  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  31.27 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  29.56 
 
 
438 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  31.76 
 
 
416 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  28.87 
 
 
418 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.72 
 
 
405 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.93 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  29.39 
 
 
329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  27.35 
 
 
399 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  28.22 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  30.33 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  32.75 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 
398 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  30.3 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  30.6 
 
 
331 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  29.68 
 
 
727 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3602  DNA-cytosine methyltransferase  61.25 
 
 
86 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526659  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
320 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 
356 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.73 
 
 
375 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  30.65 
 
 
416 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  28.3 
 
 
399 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  31.88 
 
 
320 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  26.76 
 
 
440 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  29.14 
 
 
324 aa  106  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 
434 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  29.35 
 
 
365 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  26.51 
 
 
464 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
412 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1029  putative site-specific DNA-methyltransferase  26.95 
 
 
383 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.69 
 
 
465 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  30.95 
 
 
348 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.93 
 
 
415 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  30.34 
 
 
426 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  28.03 
 
 
350 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  34.01 
 
 
443 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  29.48 
 
 
390 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  31.27 
 
 
305 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  29.19 
 
 
323 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.12 
 
 
362 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  27.95 
 
 
329 aa  100  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  30.1 
 
 
615 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  29.06 
 
 
318 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.25 
 
 
395 aa  100  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.34 
 
 
387 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 
406 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  32.56 
 
 
456 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 
428 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  32.56 
 
 
456 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  38.37 
 
 
437 aa  99.8  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  32.32 
 
 
460 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 
438 aa  99.4  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  32.32 
 
 
460 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  27.46 
 
 
350 aa  99  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 
370 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3525  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.74 
 
 
571 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000124097  hitchhiker  0.00602561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 
419 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  28.19 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  33.69 
 
 
434 aa  97.4  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  36.97 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  34.83 
 
 
446 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  27.7 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
419 aa  97.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.14 
 
 
451 aa  96.3  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01778  site-specific DNA-methyltransferase  25.27 
 
 
386 aa  95.9  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>