283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1617 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
437 aa  889    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  55.27 
 
 
419 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  54.39 
 
 
399 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  43.84 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  44.84 
 
 
399 aa  290  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  43.58 
 
 
393 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  40.43 
 
 
402 aa  289  8e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  38.8 
 
 
409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.44 
 
 
362 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 
359 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  25.88 
 
 
423 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  26.97 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  25.62 
 
 
385 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  26.83 
 
 
465 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.78 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.06 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  33.64 
 
 
662 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 
318 aa  119  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 
368 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.74 
 
 
405 aa  116  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.21 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  25.67 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  25.59 
 
 
361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  25.37 
 
 
313 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 
412 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  26.45 
 
 
335 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  26.85 
 
 
395 aa  110  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  23.86 
 
 
323 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 
652 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  22.47 
 
 
450 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  27.18 
 
 
308 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  35.21 
 
 
334 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  32.38 
 
 
632 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  29.48 
 
 
398 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  25.64 
 
 
324 aa  103  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  27.44 
 
 
406 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  26.42 
 
 
468 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  25.93 
 
 
310 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  24 
 
 
335 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  27 
 
 
415 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  23.61 
 
 
388 aa  97.4  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  25.37 
 
 
440 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  26.3 
 
 
406 aa  96.7  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  26.61 
 
 
671 aa  96.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  24.39 
 
 
329 aa  96.3  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  26.54 
 
 
454 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  23.91 
 
 
438 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  23.44 
 
 
464 aa  93.2  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  23.54 
 
 
327 aa  91.3  3e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 
418 aa  91.3  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  24.88 
 
 
434 aa  90.1  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  26.21 
 
 
399 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  26.33 
 
 
429 aa  90.1  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  31.55 
 
 
319 aa  89.4  1e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  25.6 
 
 
329 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 
488 aa  89  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
337 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  23.56 
 
 
338 aa  87.8  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  27.15 
 
 
361 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  32.05 
 
 
462 aa  87  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  33.64 
 
 
381 aa  86.3  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.85 
 
 
357 aa  84  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  26.67 
 
 
443 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  30.63 
 
 
460 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  25.68 
 
 
428 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  30.63 
 
 
460 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  25.34 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  26.78 
 
 
657 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  24.76 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  29.66 
 
 
424 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  23.87 
 
 
352 aa  82  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  24.15 
 
 
727 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  28.02 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  31.16 
 
 
489 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  28.44 
 
 
456 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  24.7 
 
 
362 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.63 
 
 
446 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  23.39 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  27.36 
 
 
426 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  28.44 
 
 
456 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  23.46 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  29.63 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  28.89 
 
 
452 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  27.51 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.62 
 
 
451 aa  78.2  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  30.73 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  25.06 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  29.17 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  29.6 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.9 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  21.5 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  28.19 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  24.04 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  29.58 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  31.34 
 
 
438 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 
389 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
416 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  27.85 
 
 
417 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  24.65 
 
 
657 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  25.91 
 
 
350 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>