More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4374 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
417 aa  864    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  68.03 
 
 
416 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  55.79 
 
 
328 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  53.87 
 
 
305 aa  335  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  41.49 
 
 
419 aa  252  9.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  43.33 
 
 
417 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  38.57 
 
 
417 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  44.38 
 
 
424 aa  243  5e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  43.38 
 
 
415 aa  243  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  43.15 
 
 
323 aa  238  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  41.19 
 
 
338 aa  236  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  40.94 
 
 
327 aa  233  3e-60  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  38.71 
 
 
428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  41.24 
 
 
426 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  39.47 
 
 
329 aa  232  9e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  40.23 
 
 
418 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  40.85 
 
 
406 aa  230  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  41.62 
 
 
425 aa  229  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  40 
 
 
436 aa  229  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  42.77 
 
 
417 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  42.73 
 
 
320 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  42.51 
 
 
416 aa  223  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  39.46 
 
 
324 aa  222  8e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  40.91 
 
 
487 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  39.62 
 
 
472 aa  216  8e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  39.62 
 
 
472 aa  216  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  39.62 
 
 
472 aa  216  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  39.47 
 
 
474 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  39.62 
 
 
472 aa  216  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  39.62 
 
 
472 aa  216  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  39.35 
 
 
472 aa  215  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  39.35 
 
 
472 aa  216  9e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  39.34 
 
 
476 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  39.34 
 
 
476 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  39.34 
 
 
476 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  39.34 
 
 
476 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  39.34 
 
 
476 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  38.57 
 
 
471 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  38.1 
 
 
491 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  39.78 
 
 
447 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  37.61 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  36.95 
 
 
311 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  36.71 
 
 
318 aa  189  5e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  35.51 
 
 
727 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  38.46 
 
 
373 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  35.69 
 
 
336 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  36.42 
 
 
657 aa  184  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  35.36 
 
 
331 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  50.79 
 
 
438 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  34.48 
 
 
350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  34.2 
 
 
350 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  35.51 
 
 
319 aa  168  1e-40  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  36.11 
 
 
329 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.63 
 
 
313 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  32.11 
 
 
308 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  33.64 
 
 
313 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  41.84 
 
 
437 aa  147  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  36.29 
 
 
467 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  31.56 
 
 
423 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  41.12 
 
 
451 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
423 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  30.21 
 
 
310 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.94 
 
 
328 aa  142  9e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  31.01 
 
 
350 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  31.82 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  37.45 
 
 
460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  37.45 
 
 
460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  28.65 
 
 
315 aa  130  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  27.46 
 
 
335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  35.18 
 
 
413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  30.59 
 
 
495 aa  126  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 
368 aa  126  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  37.36 
 
 
406 aa  124  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  33.18 
 
 
444 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
427 aa  123  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.44 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  35.65 
 
 
456 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.69 
 
 
335 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  35.65 
 
 
456 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  28.36 
 
 
359 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  31.27 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  27.6 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29 
 
 
357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  27.78 
 
 
345 aa  117  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  38.46 
 
 
483 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.48 
 
 
323 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  27.89 
 
 
415 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  27.6 
 
 
421 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  27.46 
 
 
662 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 
386 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  27.11 
 
 
490 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  26.97 
 
 
318 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  28.72 
 
 
388 aa  103  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  26.89 
 
 
313 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  35.6 
 
 
239 aa  103  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  28.41 
 
 
342 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 
379 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
434 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  33.57 
 
 
389 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.17 
 
 
415 aa  99.8  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>